More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0021 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
556 aa  1117    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  52.75 
 
 
563 aa  565  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  47.82 
 
 
565 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  44.74 
 
 
572 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  47.45 
 
 
585 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  45.54 
 
 
564 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  38.92 
 
 
582 aa  388  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 
553 aa  343  5e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  33.45 
 
 
550 aa  324  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 
555 aa  323  4e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  33.57 
 
 
550 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  34.21 
 
 
557 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.86 
 
 
569 aa  300  6e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 
545 aa  297  3e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  32.15 
 
 
540 aa  273  8.000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  31.16 
 
 
566 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
444 aa  238  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 
445 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 
472 aa  236  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  35.89 
 
 
471 aa  236  8e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  33.2 
 
 
538 aa  236  9e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.99 
 
 
445 aa  236  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
444 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  42.01 
 
 
444 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  34.36 
 
 
444 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.94 
 
 
440 aa  233  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 
477 aa  232  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 
463 aa  232  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 
507 aa  231  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
447 aa  231  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
440 aa  231  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 
440 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 
444 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 
440 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.83 
 
 
443 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 
444 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 
441 aa  228  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 
440 aa  227  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  38.38 
 
 
439 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 
440 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
428 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.21 
 
 
432 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 
442 aa  226  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  38.22 
 
 
446 aa  226  9e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.18 
 
 
443 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  34.04 
 
 
477 aa  225  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  36.06 
 
 
440 aa  225  2e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.23 
 
 
423 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  35.89 
 
 
445 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 
457 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 
440 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.27 
 
 
451 aa  223  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  33.19 
 
 
842 aa  223  7e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.94 
 
 
468 aa  223  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.98 
 
 
439 aa  223  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  41.85 
 
 
451 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 
453 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  39.05 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  33.49 
 
 
440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
438 aa  222  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 
424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.18 
 
 
441 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  40.82 
 
 
463 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 
452 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 
440 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  41.07 
 
 
415 aa  220  5e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 
457 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.98 
 
 
438 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.06 
 
 
457 aa  220  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.98 
 
 
438 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.69 
 
 
458 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.98 
 
 
438 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 
456 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.63 
 
 
426 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 
522 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  36.28 
 
 
526 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 
462 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  37.06 
 
 
549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.94 
 
 
462 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 
446 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 
455 aa  217  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 
439 aa  217  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.85 
 
 
441 aa  217  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
438 aa  217  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 
515 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 
513 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 
478 aa  216  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 
437 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 
511 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  34.76 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 
530 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  36.92 
 
 
479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 
530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  37.35 
 
 
530 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.66 
 
 
439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  37.05 
 
 
521 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  37.35 
 
 
524 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>