More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4121 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 566 aa  1144    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  44.74 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  43.28 
 
 		 550 aa  456  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  43.1 
 
 		 557 aa  438  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  39.41 
 
 		 545 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  39.67 
 
 		 540 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 569 aa  372  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 553 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.8 
 
 		 563 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.52 
 
 		 564 aa  291  2e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 		 565 aa  282  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  34.69 
 
 		 585 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  34.01 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  32.75 
 
 		 582 aa  266  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  33.85 
 
 		 556 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  34.05 
 
 		 528 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  33.04 
 
 		 842 aa  209  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 		 439 aa  209  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  32.11 
 
 		 535 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  33.02 
 
 		 538 aa  207  6e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  33.96 
 
 		 448 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 		 448 aa  204  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 		 560 aa  204  4e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  37.13 
 
 		 449 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  35.69 
 
 		 462 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  39.63 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 		 452 aa  200  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  35.47 
 
 		 435 aa  200  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.26 
 
 		 444 aa  200  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 445 aa  200  7e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 		 567 aa  199  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  37.31 
 
 		 440 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.69 
 
 		 444 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 444 aa  198  3e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  36.18 
 
 		 552 aa  197  6e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.5 
 
 		 443 aa  197  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 453 aa  196  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 439 aa  196  8.000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 441 aa  196  8.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 		 432 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  38.4 
 
 		 439 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 456 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.14 
 
 		 423 aa  194  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.5 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  36.34 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.5 
 
 		 439 aa  193  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 		 535 aa  193  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  33.75 
 
 		 440 aa  193  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  30.19 
 
 		 507 aa  193  9e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.76 
 
 		 451 aa  192  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 437 aa  193  9e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  34.38 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 455 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.94 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  34.66 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 452 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 525 aa  191  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  40.43 
 
 		 400 aa  191  4e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 506 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 445 aa  190  7e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  33.82 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  31.65 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 446 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  31.73 
 
 		 444 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 		 526 aa  188  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 428 aa  188  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 458 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  39.22 
 
 		 438 aa  187  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.45 
 
 		 471 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  35.34 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 463 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.71 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  31.49 
 
 		 441 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  35.31 
 
 		 444 aa  187  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.14 
 
 		 440 aa  187  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 440 aa  187  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.14 
 
 		 440 aa  187  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 398 aa  187  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  35.42 
 
 		 424 aa  186  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 410 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 437 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  37.69 
 
 		 468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 438 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>