More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1722 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 560 aa  1116    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  54.37 
 
 		 556 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  38.94 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 567 aa  355  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  36.38 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  43.51 
 
 		 507 aa  343  4e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  37.45 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.12 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  36.38 
 
 		 544 aa  342  1e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  37.77 
 
 		 552 aa  337  2.9999999999999997e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  39.59 
 
 		 555 aa  333  4e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 535 aa  331  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  38.32 
 
 		 551 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  36.73 
 
 		 549 aa  322  8e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  36.04 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 547 aa  321  1.9999999999999998e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 		 556 aa  317  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  36.06 
 
 		 535 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  40.78 
 
 		 526 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  32.87 
 
 		 544 aa  263  4.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 		 550 aa  233  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.08 
 
 		 455 aa  231  3e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.43 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.84 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  34.41 
 
 		 563 aa  226  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 		 468 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 432 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.89 
 
 		 443 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  33.92 
 
 		 572 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 		 451 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 444 aa  223  9e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.96 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 		 428 aa  223  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  40.81 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.92 
 
 		 445 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.92 
 
 		 445 aa  222  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  38.5 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  38.5 
 
 		 440 aa  221  3e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 455 aa  221  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  31.36 
 
 		 550 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 458 aa  220  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.51 
 
 		 423 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  38.94 
 
 		 553 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 		 566 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.54 
 
 		 439 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 423 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  39.33 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.34 
 
 		 426 aa  217  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 		 585 aa  216  7e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.91 
 
 		 450 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.92 
 
 		 441 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.83 
 
 		 569 aa  214  1.9999999999999998e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.69 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 		 498 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  31.24 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.48 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38 
 
 		 482 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  37.47 
 
 		 448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.47 
 
 		 448 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  32.89 
 
 		 582 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.88 
 
 		 457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  32.54 
 
 		 565 aa  213  7e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  36.86 
 
 		 564 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 		 452 aa  213  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  36.51 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  30.37 
 
 		 557 aa  212  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  36.5 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 452 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 		 444 aa  210  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.68 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.68 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 		 457 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  39.04 
 
 		 446 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  37.26 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  35.87 
 
 		 468 aa  206  8e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 445 aa  206  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 476 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  37.53 
 
 		 480 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  30.16 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 410 aa  205  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>