More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6540 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 535 aa  1103    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  41.11 
 
 		 535 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  42.75 
 
 		 528 aa  424  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 575 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  38.93 
 
 		 526 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  37.76 
 
 		 525 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  41.02 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  39.08 
 
 		 544 aa  351  2e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  39.48 
 
 		 556 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  39 
 
 		 544 aa  344  2e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  38.31 
 
 		 560 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.8 
 
 		 552 aa  310  5e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  34.3 
 
 		 556 aa  299  8e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  34.97 
 
 		 551 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  32.83 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  33.27 
 
 		 549 aa  280  5e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  33.21 
 
 		 555 aa  280  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  33.46 
 
 		 535 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  39.51 
 
 		 551 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.64 
 
 		 538 aa  239  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  29.43 
 
 		 540 aa  216  9e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.51 
 
 		 439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  30.71 
 
 		 550 aa  212  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 		 555 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 		 432 aa  207  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  28.43 
 
 		 545 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  34.51 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  32.08 
 
 		 565 aa  205  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  32.53 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.05 
 
 		 468 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.01 
 
 		 445 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  38.7 
 
 		 444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  35.07 
 
 		 564 aa  200  6e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.29 
 
 		 445 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  28.6 
 
 		 572 aa  199  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.89 
 
 		 450 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  29.54 
 
 		 557 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 		 566 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 482 aa  197  6e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  38.65 
 
 		 507 aa  196  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  31.5 
 
 		 550 aa  196  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 423 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.06 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  37.58 
 
 		 482 aa  194  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 482 aa  194  4e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.82 
 
 		 437 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.91 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  31.33 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.54 
 
 		 439 aa  191  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 		 438 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  36.16 
 
 		 426 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  36.52 
 
 		 480 aa  190  7e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  36.19 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  36.19 
 
 		 448 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 438 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 438 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 418 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  34.81 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  34.18 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 476 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 481 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 440 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.11 
 
 		 439 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  37.18 
 
 		 456 aa  186  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 		 429 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  36.17 
 
 		 478 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  32.4 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  32.96 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  37.96 
 
 		 397 aa  186  9e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 		 479 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  37.18 
 
 		 456 aa  186  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 418 aa  185  2.0000000000000003e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  34.24 
 
 		 441 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  32.96 
 
 		 444 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 490 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 428 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  34.25 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  34.16 
 
 		 439 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  33.89 
 
 		 479 aa  183  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 		 452 aa  183  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.56 
 
 		 449 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  28.35 
 
 		 553 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.83 
 
 		 457 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 415 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.58 
 
 		 451 aa  181  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.51 
 
 		 456 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  33.81 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>