More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3606 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 418 aa  844    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  42.74 
 
 		 401 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 415 aa  274  3e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  42.9 
 
 		 398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  41.21 
 
 		 428 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  40.93 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  41.09 
 
 		 383 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  41.01 
 
 		 397 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  41.74 
 
 		 379 aa  258  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.3 
 
 		 468 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.95 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 		 452 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  39.02 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.25 
 
 		 440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 443 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  41.33 
 
 		 442 aa  243  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 377 aa  243  6e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.74 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.19 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.2 
 
 		 438 aa  237  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.58 
 
 		 443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 383 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 428 aa  236  8e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  33.76 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 		 444 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.27 
 
 		 443 aa  233  6e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 		 461 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 		 410 aa  232  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.11 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 		 438 aa  230  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  34.4 
 
 		 445 aa  230  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  35.56 
 
 		 439 aa  230  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  33.42 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  39.53 
 
 		 489 aa  230  5e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 433 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.54 
 
 		 445 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 446 aa  229  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  33.1 
 
 		 455 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 		 437 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.8 
 
 		 444 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.25 
 
 		 438 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 		 429 aa  227  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.83 
 
 		 428 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 440 aa  226  9e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 440 aa  226  9e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.18 
 
 		 444 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  36.64 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  36.64 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 		 446 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  37.08 
 
 		 440 aa  224  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  34.97 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  34.97 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  38.02 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.18 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.54 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 436 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  34.63 
 
 		 457 aa  223  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  33.85 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  36.5 
 
 		 456 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 		 481 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 		 456 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  35.87 
 
 		 451 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  36.64 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  36.31 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  40.71 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  36.64 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 		 423 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  34.95 
 
 		 451 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  36.12 
 
 		 476 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 415 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 		 418 aa  219  7.999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 		 458 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 		 479 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 458 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  35.12 
 
 		 453 aa  218  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.47 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  34.51 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 		 481 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>