More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1010 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
547 aa  1082    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  54.31 
 
 
535 aa  581  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  51.19 
 
 
556 aa  518  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  49.91 
 
 
551 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 
555 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  48.26 
 
 
549 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  47.34 
 
 
551 aa  482  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  38.22 
 
 
567 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  36.93 
 
 
528 aa  326  7e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  45.23 
 
 
556 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 
575 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  35.39 
 
 
525 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  47.32 
 
 
560 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  33.88 
 
 
535 aa  297  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 
526 aa  277  5e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  39.86 
 
 
507 aa  272  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  32.83 
 
 
535 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.01 
 
 
552 aa  265  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  32.24 
 
 
544 aa  264  3e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
544 aa  250  4e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.01 
 
 
450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  38.29 
 
 
438 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
538 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 
433 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 
423 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  41.08 
 
 
441 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
444 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.51 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 
455 aa  219  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.31 
 
 
443 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.47 
 
 
429 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36 
 
 
444 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 
452 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 
422 aa  216  7e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.38 
 
 
468 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.38 
 
 
443 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 
398 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  38.86 
 
 
439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 
434 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 
410 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  38.46 
 
 
457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 
428 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.14 
 
 
426 aa  213  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 
446 aa  213  7.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 
480 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
379 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 
428 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  34.31 
 
 
478 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
397 aa  211  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 
428 aa  210  4e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  36.92 
 
 
383 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 
429 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 
432 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 
439 aa  209  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  34.31 
 
 
478 aa  209  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.12 
 
 
439 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 
443 aa  209  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.71 
 
 
436 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 
482 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.71 
 
 
436 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 
469 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 
476 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  39 
 
 
444 aa  207  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  35.21 
 
 
442 aa  207  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
478 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.69 
 
 
423 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 
482 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40.63 
 
 
482 aa  205  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 
415 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
438 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  33.94 
 
 
469 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
478 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
478 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
469 aa  204  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  33.94 
 
 
478 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
478 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  40 
 
 
451 aa  204  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 
442 aa  204  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.74 
 
 
438 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  33 
 
 
550 aa  204  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.78 
 
 
445 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 
456 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 
458 aa  203  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 
451 aa  203  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
439 aa  203  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 
440 aa  203  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 
437 aa  203  8e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
478 aa  202  9e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  36.84 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  36.84 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.78 
 
 
445 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.14 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  37.9 
 
 
444 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.1 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
545 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>