More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3783 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
434 aa  867    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 
410 aa  286  7e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 
444 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.18 
 
 
450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 
446 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 
444 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.02 
 
 
457 aa  272  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 
418 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 
455 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.29 
 
 
444 aa  268  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  44.55 
 
 
458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  43.6 
 
 
444 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  43.4 
 
 
438 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  43.29 
 
 
452 aa  266  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 
428 aa  266  8e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.51 
 
 
443 aa  264  3e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.8 
 
 
441 aa  263  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  41.44 
 
 
482 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  41.44 
 
 
482 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
432 aa  260  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  43.73 
 
 
426 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 
456 aa  260  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  43.6 
 
 
443 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  40.42 
 
 
440 aa  259  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.58 
 
 
439 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  36.5 
 
 
447 aa  258  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.53 
 
 
438 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 
438 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  44.92 
 
 
436 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  44.92 
 
 
436 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 
438 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.38 
 
 
462 aa  256  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  46.41 
 
 
437 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 
438 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37.05 
 
 
445 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  40.21 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  45.25 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.68 
 
 
445 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.95 
 
 
468 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  33.81 
 
 
476 aa  252  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  43.65 
 
 
439 aa  252  8.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.95 
 
 
457 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.21 
 
 
445 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.21 
 
 
445 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 
441 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.67 
 
 
439 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  42.72 
 
 
472 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 
458 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  42.2 
 
 
461 aa  247  3e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  44.82 
 
 
437 aa  247  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.61 
 
 
422 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  36.38 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.22 
 
 
433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 
456 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  36.38 
 
 
440 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  36.38 
 
 
440 aa  245  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.69 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  35.24 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.26 
 
 
451 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 
379 aa  244  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 
440 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  43.2 
 
 
507 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.56 
 
 
423 aa  242  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 
440 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  34.4 
 
 
445 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  42.38 
 
 
440 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 
446 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 
481 aa  240  4e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 
471 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  44.21 
 
 
437 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.63 
 
 
444 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
441 aa  239  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  37.47 
 
 
478 aa  239  5.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  43.12 
 
 
415 aa  239  6.999999999999999e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  38.28 
 
 
515 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 
444 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  37.76 
 
 
549 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  36.98 
 
 
478 aa  236  6e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.6 
 
 
515 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.6 
 
 
515 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.6 
 
 
515 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  36.98 
 
 
478 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  41.16 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.93 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 
575 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  40.61 
 
 
398 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 
511 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 
513 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  37.34 
 
 
515 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  38.44 
 
 
532 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 
462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  37.34 
 
 
400 aa  233  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  36.79 
 
 
479 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 
444 aa  233  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  37.44 
 
 
440 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  35.97 
 
 
538 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>