More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04000 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  100 
 
 		 535 aa  1078    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  54.49 
 
 		 525 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  46.33 
 
 		 552 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  43.05 
 
 		 528 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  41.11 
 
 		 535 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  40.64 
 
 		 575 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  40.9 
 
 		 567 aa  359  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  38.71 
 
 		 556 aa  333  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  39.11 
 
 		 507 aa  329  8e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 560 aa  327  5e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 526 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 		 535 aa  309  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 		 555 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 544 aa  306  8.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 		 556 aa  298  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  38.78 
 
 		 551 aa  297  3e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 		 547 aa  297  4e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  36.98 
 
 		 549 aa  289  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  33.02 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  38.84 
 
 		 551 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  32.8 
 
 		 550 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  33.11 
 
 		 540 aa  220  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 		 545 aa  213  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  34.18 
 
 		 434 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  34.82 
 
 		 444 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  33.81 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.1 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 		 566 aa  206  6e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 		 446 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  28.65 
 
 		 538 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  31.57 
 
 		 572 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  36.17 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  30.72 
 
 		 557 aa  202  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.69 
 
 		 443 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  36.23 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.96 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  33.71 
 
 		 439 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  30.32 
 
 		 582 aa  195  1e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  35.71 
 
 		 426 aa  196  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.09 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  34.39 
 
 		 569 aa  194  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 423 aa  193  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.28 
 
 		 452 aa  194  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  32.79 
 
 		 441 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  31.81 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  31.13 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.56 
 
 		 455 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  32.38 
 
 		 550 aa  191  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.33 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  31.77 
 
 		 439 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  34.5 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  32.5 
 
 		 444 aa  189  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.57 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.57 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  33.91 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  33.55 
 
 		 439 aa  187  5e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.95 
 
 		 440 aa  186  9e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  32.89 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  35.39 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 		 468 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 		 553 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 398 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  35 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  32.45 
 
 		 556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.22 
 
 		 441 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  32.52 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  32.09 
 
 		 444 aa  183  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  33.24 
 
 		 419 aa  183  8.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 		 565 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.56 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  32.64 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  36.48 
 
 		 507 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 		 456 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  31.81 
 
 		 461 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  32.82 
 
 		 532 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  32.51 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  33.89 
 
 		 438 aa  181  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  32.51 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  31.32 
 
 		 549 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  32.92 
 
 		 462 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 		 438 aa  180  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  34.28 
 
 		 445 aa  179  8e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  33.55 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 		 477 aa  179  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  31.68 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 		 418 aa  179  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  32.51 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  31.86 
 
 		 440 aa  178  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  31.32 
 
 		 538 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  31.83 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  31.49 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  31.83 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  31.83 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>