More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0689 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  100 
 
 
528 aa  1077    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  53.63 
 
 
575 aa  552  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  50.19 
 
 
567 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  45.21 
 
 
544 aa  473  1e-132  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  43.05 
 
 
535 aa  425  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  43.8 
 
 
507 aa  418  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  42.75 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  41.03 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  39.85 
 
 
556 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 
560 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
526 aa  336  5.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 
535 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 
547 aa  326  6e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 
544 aa  326  7e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 
552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  36.82 
 
 
556 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  34.97 
 
 
549 aa  319  6e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 
555 aa  318  1e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  36.98 
 
 
551 aa  317  3e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  46.86 
 
 
551 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 
538 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  36.65 
 
 
550 aa  249  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.94 
 
 
443 aa  240  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.46 
 
 
443 aa  239  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  34.39 
 
 
540 aa  236  6e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 
444 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  37.67 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 
444 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.09 
 
 
455 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  38.07 
 
 
450 aa  229  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 
438 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  37.47 
 
 
444 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  34.24 
 
 
545 aa  225  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
433 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.43 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  35.32 
 
 
434 aa  223  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  37.14 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.05 
 
 
439 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.19 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 
429 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
446 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
452 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  33.58 
 
 
476 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.11 
 
 
468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 
458 aa  217  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
563 aa  217  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.22 
 
 
426 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.05 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  34.05 
 
 
566 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 
428 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 
456 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  37.18 
 
 
434 aa  213  9e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  32.53 
 
 
569 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  35.8 
 
 
432 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  39.18 
 
 
498 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
507 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
437 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  33.18 
 
 
555 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
441 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
437 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.68 
 
 
440 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 
461 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 
478 aa  207  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.25 
 
 
564 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 
415 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 
428 aa  207  5e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  35.45 
 
 
423 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 
444 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 
422 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  38.08 
 
 
456 aa  205  1e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40.82 
 
 
423 aa  206  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.15 
 
 
445 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.15 
 
 
445 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  35.64 
 
 
480 aa  205  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
451 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
458 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  31.62 
 
 
557 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 
481 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.03 
 
 
445 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  37.77 
 
 
456 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 
456 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.51 
 
 
440 aa  204  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 
444 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  34.08 
 
 
483 aa  204  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
459 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.05 
 
 
445 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  39.24 
 
 
451 aa  203  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
457 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  35.74 
 
 
437 aa  203  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
481 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  36.54 
 
 
482 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  33.6 
 
 
478 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  34.15 
 
 
468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  34.71 
 
 
462 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  35.04 
 
 
444 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 
484 aa  201  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  35.87 
 
 
480 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  36.06 
 
 
479 aa  201  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  30.63 
 
 
550 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>