More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0235 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 507 aa  1041    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  43.8 
 
 		 528 aa  418  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  42.54 
 
 		 556 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  42.08 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  39.33 
 
 		 544 aa  362  1e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 		 535 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  42.22 
 
 		 575 aa  356  5.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 		 525 aa  332  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  39.11 
 
 		 535 aa  329  7e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  43.07 
 
 		 560 aa  324  2e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  40.92 
 
 		 544 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  37.98 
 
 		 552 aa  300  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 		 526 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 535 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  36.01 
 
 		 551 aa  279  9e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  37.23 
 
 		 555 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  36.16 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  39.86 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  35.27 
 
 		 549 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 		 556 aa  228  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  29.62 
 
 		 540 aa  225  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  34.16 
 
 		 545 aa  219  7.999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.73 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  40.12 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  31.37 
 
 		 550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  42.11 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  34.57 
 
 		 564 aa  210  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  32.5 
 
 		 572 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  41.74 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 		 478 aa  209  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.08 
 
 		 563 aa  209  7e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  42.99 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  30.48 
 
 		 557 aa  207  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  42.5 
 
 		 440 aa  206  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 		 550 aa  206  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  42.04 
 
 		 507 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  41.05 
 
 		 498 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  39.14 
 
 		 553 aa  204  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 		 440 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 446 aa  203  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 		 479 aa  203  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  32.26 
 
 		 565 aa  203  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  36.84 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 		 422 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  41.88 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.89 
 
 		 423 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  40.95 
 
 		 483 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.96 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.64 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  38.62 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.58 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.82 
 
 		 445 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  39.94 
 
 		 468 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 444 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  39.03 
 
 		 440 aa  199  7.999999999999999e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  40.06 
 
 		 450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.67 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  37.35 
 
 		 480 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  39.07 
 
 		 482 aa  198  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  37.54 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 428 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  38.49 
 
 		 494 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.29 
 
 		 443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 		 535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 		 478 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 468 aa  197  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 439 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  41.88 
 
 		 415 aa  196  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 452 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.85 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  37.35 
 
 		 479 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 		 569 aa  195  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  40.87 
 
 		 484 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 515 aa  195  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  38.91 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.75 
 
 		 423 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.96 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 478 aa  194  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 445 aa  194  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  38.75 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  38.75 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 		 496 aa  194  4e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 		 530 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 		 481 aa  194  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>