More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0813 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  62.89 
 
 
555 aa  706    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  61.57 
 
 
549 aa  693    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  100 
 
 
551 aa  1115    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  66.61 
 
 
556 aa  756    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  59.74 
 
 
551 aa  696    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 
535 aa  495  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  47.71 
 
 
547 aa  484  1e-135  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  46.38 
 
 
567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 
556 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
575 aa  321  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  36.98 
 
 
528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  36.19 
 
 
560 aa  307  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  37.77 
 
 
526 aa  293  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  39.9 
 
 
525 aa  290  6e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  33.96 
 
 
535 aa  283  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 
507 aa  280  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  31.7 
 
 
535 aa  259  6e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  42.3 
 
 
552 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  40.96 
 
 
450 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  38.15 
 
 
544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.53 
 
 
444 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 
444 aa  237  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.12 
 
 
438 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 
444 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 
452 aa  234  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 
428 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.43 
 
 
443 aa  232  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.77 
 
 
443 aa  230  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.77 
 
 
423 aa  228  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  42.99 
 
 
439 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  42.19 
 
 
426 aa  228  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  39.27 
 
 
457 aa  227  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  42.31 
 
 
440 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  42.45 
 
 
498 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.89 
 
 
439 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  42.59 
 
 
484 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  39.56 
 
 
482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 
441 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  42.04 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.94 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.94 
 
 
445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  41.59 
 
 
507 aa  222  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  41.38 
 
 
461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 
440 aa  221  3e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  34.19 
 
 
410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 
438 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 
438 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.54 
 
 
429 aa  219  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 
438 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.54 
 
 
441 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 
434 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 
455 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.32 
 
 
458 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 
422 aa  217  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  37.11 
 
 
439 aa  217  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 
379 aa  216  8e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  40.89 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  41.64 
 
 
484 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  41.85 
 
 
415 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  37.61 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 
456 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  40.07 
 
 
455 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.29 
 
 
468 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 
437 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.87 
 
 
446 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.71 
 
 
445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.71 
 
 
445 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.14 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  37.32 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 
424 aa  213  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 
442 aa  213  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  36.69 
 
 
544 aa  212  1e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 
444 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 
444 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  36.9 
 
 
475 aa  212  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.53 
 
 
436 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 
424 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.53 
 
 
436 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.78 
 
 
434 aa  210  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 
428 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.78 
 
 
439 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  36.62 
 
 
435 aa  209  8e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  38.84 
 
 
448 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  33.81 
 
 
418 aa  209  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 
432 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  38.84 
 
 
448 aa  209  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 
476 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 
440 aa  208  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  40.29 
 
 
463 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 
443 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 
401 aa  207  3e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  38.26 
 
 
441 aa  207  4e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  37.03 
 
 
444 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 
471 aa  207  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>