More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3921 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  61.57 
 
 		 575 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 567 aa  1149    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  50.19 
 
 		 528 aa  571  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  42.12 
 
 		 544 aa  422  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  42.28 
 
 		 507 aa  385  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  41.24 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  40.9 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  40.48 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  41.02 
 
 		 535 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  38.65 
 
 		 560 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  40.85 
 
 		 544 aa  339  9e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  39 
 
 		 547 aa  336  9e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 		 555 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  44.98 
 
 		 556 aa  331  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  38.4 
 
 		 549 aa  331  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  38.31 
 
 		 551 aa  330  3e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 552 aa  327  4.0000000000000003e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  39.41 
 
 		 535 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  37.98 
 
 		 551 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  36.33 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  36.2 
 
 		 550 aa  261  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  34.56 
 
 		 538 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  38.95 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.2 
 
 		 443 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.66 
 
 		 443 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  40.95 
 
 		 444 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  35.25 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  32.64 
 
 		 557 aa  233  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  39.04 
 
 		 444 aa  231  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 		 455 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 444 aa  230  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.51 
 
 		 457 aa  229  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  38.29 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 458 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 452 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 		 550 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  38.16 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 428 aa  225  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.69 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 		 433 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 		 438 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 456 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  31.45 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 424 aa  221  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  35.59 
 
 		 434 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.05 
 
 		 439 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 459 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 437 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.23 
 
 		 426 aa  220  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.08 
 
 		 457 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 458 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.01 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.01 
 
 		 445 aa  219  1e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  35.88 
 
 		 441 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 		 429 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36 
 
 		 418 aa  218  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 		 451 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.68 
 
 		 451 aa  216  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 		 443 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 		 566 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 		 452 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.8 
 
 		 423 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  35.64 
 
 		 468 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 		 439 aa  213  7.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  38.67 
 
 		 437 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  37.14 
 
 		 440 aa  213  9e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  32.7 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  38.41 
 
 		 482 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 		 432 aa  211  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  34.38 
 
 		 439 aa  210  6e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 440 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 445 aa  209  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 440 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 		 398 aa  209  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  34.61 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 478 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  31.89 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 428 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  34.58 
 
 		 478 aa  206  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  34.58 
 
 		 469 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.99 
 
 		 428 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>