More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0293 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  97.2 
 
 		 428 aa  800    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 428 aa  849    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  44.6 
 
 		 398 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  38.68 
 
 		 397 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  40.93 
 
 		 418 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  41.76 
 
 		 429 aa  263  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 		 480 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  38.5 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  44.17 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.08 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  42.32 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  40.76 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.67 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  41.84 
 
 		 445 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 482 aa  243  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  41.44 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 458 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  41.44 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  41.44 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  39.43 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 456 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 457 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.23 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  36.61 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.23 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 442 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.84 
 
 		 439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  41.59 
 
 		 451 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.52 
 
 		 439 aa  235  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 		 444 aa  235  9e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 383 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.42 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 428 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.69 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  40.85 
 
 		 444 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  38.27 
 
 		 425 aa  233  6e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  38.57 
 
 		 463 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 		 383 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 		 392 aa  232  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  39.63 
 
 		 471 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 427 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  39.73 
 
 		 457 aa  230  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  37.13 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 478 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  38.9 
 
 		 450 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  38.58 
 
 		 446 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  40.46 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 		 478 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  37.68 
 
 		 480 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  34.73 
 
 		 480 aa  229  8e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  38.6 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  35.04 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  39 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 515 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  36.7 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.53 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.53 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.49 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  38.01 
 
 		 434 aa  227  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 440 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.16 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  34.86 
 
 		 515 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  36.13 
 
 		 511 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 		 513 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  38.94 
 
 		 435 aa  226  9e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  37.4 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 		 445 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 418 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.78 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 		 445 aa  224  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  36.32 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  37.54 
 
 		 524 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 		 478 aa  223  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  37.54 
 
 		 524 aa  223  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>