More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1403 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 555 aa  1120    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  65.16 
 
 		 556 aa  746    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  63.8 
 
 		 549 aa  709    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  62.16 
 
 		 551 aa  689    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  67.4 
 
 		 551 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  48.26 
 
 		 535 aa  512  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 547 aa  505  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 		 575 aa  328  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  45.29 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 560 aa  326  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  36.01 
 
 		 528 aa  318  1e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 		 556 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  38.96 
 
 		 535 aa  309  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  42.78 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 		 526 aa  289  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  37.23 
 
 		 507 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  33.21 
 
 		 535 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 		 552 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  41.26 
 
 		 438 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.48 
 
 		 450 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 444 aa  234  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.17 
 
 		 443 aa  233  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  31.08 
 
 		 544 aa  233  9e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  43.83 
 
 		 439 aa  233  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  42.68 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.75 
 
 		 410 aa  231  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  43.97 
 
 		 445 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  43.97 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.11 
 
 		 538 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.34 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 		 544 aa  227  5.0000000000000005e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  38.31 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  37.66 
 
 		 434 aa  226  6e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  41.61 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  41.61 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.93 
 
 		 443 aa  226  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  44.3 
 
 		 438 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 438 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  37.68 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  44.3 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 		 441 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  44.3 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  41.09 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  43.32 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 432 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 		 445 aa  221  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.76 
 
 		 426 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  41.59 
 
 		 446 aa  220  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  42.67 
 
 		 439 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  40.69 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  42.67 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  42.67 
 
 		 436 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.89 
 
 		 461 aa  217  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  38.29 
 
 		 423 aa  217  5e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 379 aa  217  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.5 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.5 
 
 		 445 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 		 455 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 		 455 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.89 
 
 		 440 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.94 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.68 
 
 		 429 aa  213  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  38.02 
 
 		 456 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  36.7 
 
 		 550 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  37.72 
 
 		 456 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.78 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 428 aa  211  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  39.37 
 
 		 444 aa  210  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  40.19 
 
 		 484 aa  209  8e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 		 440 aa  209  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  35.95 
 
 		 475 aa  209  9e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 		 418 aa  209  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 463 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.38 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 		 453 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  37.73 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.85 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  37.42 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  39.17 
 
 		 449 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  38.54 
 
 		 441 aa  206  6e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 446 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.31 
 
 		 419 aa  206  7e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>