More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0972 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  56.48 
 
 
540 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
545 aa  1102    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  44.59 
 
 
550 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  41.82 
 
 
550 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
557 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  37.48 
 
 
555 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  39.41 
 
 
566 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
569 aa  331  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
553 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 
556 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  32.75 
 
 
572 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 
563 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 
565 aa  276  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  31.53 
 
 
564 aa  273  5.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  32.46 
 
 
582 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  33.21 
 
 
585 aa  267  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 
398 aa  232  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  40.23 
 
 
435 aa  226  8e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  34.24 
 
 
528 aa  225  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  39.59 
 
 
575 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.56 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  34.16 
 
 
507 aa  219  8.999999999999998e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
556 aa  219  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
567 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  38.81 
 
 
444 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
439 aa  217  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.81 
 
 
444 aa  216  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  38.81 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 
444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 
444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  38.35 
 
 
434 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  32.36 
 
 
535 aa  213  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 
410 aa  213  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 
552 aa  212  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.56 
 
 
443 aa  212  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.93 
 
 
538 aa  211  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 
418 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  34.6 
 
 
842 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.56 
 
 
443 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 
428 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 
458 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 
456 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.33 
 
 
439 aa  206  6e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  28.43 
 
 
535 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  35.86 
 
 
463 aa  206  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
446 aa  205  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.26 
 
 
379 aa  206  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  33.65 
 
 
440 aa  206  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 
438 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  38.2 
 
 
419 aa  204  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
525 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  38.26 
 
 
439 aa  204  4e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.46 
 
 
429 aa  203  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.15 
 
 
450 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.75 
 
 
444 aa  203  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 
452 aa  203  7e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.79 
 
 
455 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 
415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 
445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
547 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
441 aa  201  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  36.79 
 
 
461 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  37.19 
 
 
457 aa  200  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  36.72 
 
 
455 aa  200  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  35.91 
 
 
448 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 
448 aa  200  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  35.96 
 
 
440 aa  199  9e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 
444 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 
449 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  37.29 
 
 
400 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 
478 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 
437 aa  199  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
440 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 
440 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
440 aa  198  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.56 
 
 
443 aa  197  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 
441 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  35.52 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  28.7 
 
 
544 aa  196  9e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  30.46 
 
 
476 aa  196  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 
437 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  31.24 
 
 
560 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 
445 aa  195  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 
428 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  34.64 
 
 
478 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
478 aa  195  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  37.15 
 
 
438 aa  195  2e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
432 aa  194  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 
453 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.06 
 
 
471 aa  194  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  35.1 
 
 
472 aa  194  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  34.23 
 
 
458 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  30.22 
 
 
535 aa  193  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
428 aa  193  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  34.34 
 
 
480 aa  192  9e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
434 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  34.69 
 
 
426 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>