More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1857 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
429 aa  870    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  53.99 
 
 
415 aa  420  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 
418 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  43.58 
 
 
398 aa  276  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  42.39 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  42.03 
 
 
428 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  41.76 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 
397 aa  256  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
377 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.52 
 
 
468 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  42.72 
 
 
442 aa  251  3e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  38.23 
 
 
383 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
395 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 
455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  35.49 
 
 
476 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  37.78 
 
 
482 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 
482 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  39 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  38.34 
 
 
425 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.25 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  34.72 
 
 
428 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 
478 aa  233  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  34.41 
 
 
432 aa  233  5e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  37.64 
 
 
389 aa  233  7.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.16 
 
 
438 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.2 
 
 
441 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.56 
 
 
410 aa  229  5e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
469 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
440 aa  229  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
469 aa  229  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
478 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
478 aa  229  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
478 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
469 aa  229  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
478 aa  229  8e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 
379 aa  227  3e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  39.01 
 
 
478 aa  226  4e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.65 
 
 
443 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.77 
 
 
439 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
437 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  37.04 
 
 
480 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  38.74 
 
 
478 aa  224  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 
478 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  34.46 
 
 
498 aa  224  3e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
438 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 
481 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 
418 aa  223  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  36.29 
 
 
387 aa  222  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  37.2 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  36.8 
 
 
478 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.48 
 
 
444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 
429 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
429 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 
479 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  38.14 
 
 
475 aa  220  3e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.94 
 
 
445 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
458 aa  219  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.22 
 
 
446 aa  220  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.31 
 
 
443 aa  220  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36 
 
 
455 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  35.58 
 
 
479 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37.65 
 
 
445 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.54 
 
 
439 aa  219  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 
456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 
451 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  38.96 
 
 
453 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 
441 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 
392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
427 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  36.34 
 
 
457 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 
452 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  37.53 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
480 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  35.45 
 
 
479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  32.45 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  32.8 
 
 
443 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 
478 aa  213  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 
478 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
439 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
461 aa  213  7e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  35.82 
 
 
478 aa  213  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.89 
 
 
451 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 
482 aa  212  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 
556 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 
507 aa  212  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.66 
 
 
452 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
446 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  33.76 
 
 
484 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  34.74 
 
 
462 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  36.05 
 
 
456 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  38.39 
 
 
450 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 
547 aa  210  4e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>