More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4427 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
554 aa  1129    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  34.86 
 
 
564 aa  327  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
470 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  37.77 
 
 
401 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  33.99 
 
 
476 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
398 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
377 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  33.71 
 
 
397 aa  200  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  34.7 
 
 
439 aa  199  9e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 
377 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 
710 aa  199  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 
472 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  31.79 
 
 
442 aa  198  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  31.9 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  36.13 
 
 
560 aa  196  9e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  33.44 
 
 
444 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  34.18 
 
 
377 aa  196  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
418 aa  196  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  33.14 
 
 
383 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  32.71 
 
 
446 aa  196  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  35.02 
 
 
434 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  35.38 
 
 
431 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
377 aa  194  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  35.24 
 
 
407 aa  194  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 
401 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  35.2 
 
 
426 aa  193  6e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  31.71 
 
 
432 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  35.22 
 
 
446 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 
494 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  34.7 
 
 
434 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
446 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 
422 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 
505 aa  191  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
415 aa  191  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.56 
 
 
455 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  33.62 
 
 
424 aa  190  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  33.62 
 
 
424 aa  190  5.999999999999999e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  33.13 
 
 
423 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 
428 aa  190  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  30.77 
 
 
444 aa  190  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  35.02 
 
 
429 aa  189  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  32 
 
 
457 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  33.45 
 
 
425 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 
418 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
433 aa  189  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  31.4 
 
 
428 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.6 
 
 
440 aa  188  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  32.73 
 
 
458 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  31.69 
 
 
379 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.89 
 
 
443 aa  187  4e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  31.13 
 
 
428 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  35.86 
 
 
556 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  32.42 
 
 
456 aa  187  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  32.11 
 
 
428 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33.12 
 
 
423 aa  186  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  31.73 
 
 
478 aa  186  8e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
440 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 
413 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 
413 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 
440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  33.65 
 
 
418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
496 aa  186  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  33.44 
 
 
435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  35.08 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  31.82 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  31.31 
 
 
468 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  30.88 
 
 
482 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  31 
 
 
439 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  32.63 
 
 
429 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  32.33 
 
 
387 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  31.91 
 
 
451 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  30.88 
 
 
482 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  31.63 
 
 
453 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  29.95 
 
 
444 aa  184  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  31.66 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  31.66 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  31.31 
 
 
451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 
383 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  30.26 
 
 
498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 
434 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
446 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  31.48 
 
 
427 aa  182  9.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.85 
 
 
471 aa  183  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 
440 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  31.61 
 
 
439 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 
458 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  33.44 
 
 
416 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  32.19 
 
 
445 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  32.11 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  32.12 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.62 
 
 
410 aa  181  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
447 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  33.23 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  34.46 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  32.85 
 
 
477 aa  180  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>