More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_308 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  92.02 
 
 		 377 aa  691    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 377 aa  749    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  88.59 
 
 		 377 aa  670    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.73 
 
 		 462 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  38.63 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  41.36 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  40.37 
 
 		 426 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 479 aa  232  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  37.53 
 
 		 477 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 477 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.89 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.94 
 
 		 439 aa  227  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.46 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 441 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 		 478 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  35.36 
 
 		 478 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 452 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  39.41 
 
 		 535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.12 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 436 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  39.09 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  39.09 
 
 		 438 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 436 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  34.56 
 
 		 478 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 		 515 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  34.14 
 
 		 479 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  39.82 
 
 		 530 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.79 
 
 		 438 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  40.12 
 
 		 521 aa  215  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 524 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 530 aa  215  9e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  39.82 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  39.82 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  39.12 
 
 		 532 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  38.76 
 
 		 515 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.74 
 
 		 443 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  33.06 
 
 		 480 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  39.82 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  39.82 
 
 		 524 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.27 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  34.79 
 
 		 478 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 		 468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 440 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.47 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.08 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 		 481 aa  212  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 530 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 550 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 538 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 513 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 511 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 438 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.75 
 
 		 443 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  36.21 
 
 		 549 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 433 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 		 538 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 377 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.84 
 
 		 444 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  37.89 
 
 		 481 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 		 439 aa  209  8e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  35.97 
 
 		 441 aa  208  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  40.72 
 
 		 526 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  40.72 
 
 		 522 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.34 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.58 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 444 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 		 379 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.94 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 476 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.62 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  38.93 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  35.52 
 
 		 428 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 		 453 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.8 
 
 		 428 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.16 
 
 		 439 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 445 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  34.5 
 
 		 398 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.01 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  36.31 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.69 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.26 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.11 
 
 		 446 aa  204  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>