More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0346 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  88.03 
 
 		 377 aa  664    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  88.59 
 
 		 377 aa  670    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 377 aa  753    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 423 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.77 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  42.9 
 
 		 440 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  40.3 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.82 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 		 432 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.45 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 477 aa  226  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 439 aa  225  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.67 
 
 		 439 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 		 479 aa  223  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 477 aa  223  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 479 aa  222  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  39.7 
 
 		 441 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  38.79 
 
 		 535 aa  220  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 438 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  37.67 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  37.67 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  36.04 
 
 		 478 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  36.04 
 
 		 478 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  39.23 
 
 		 530 aa  215  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 		 437 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  37.96 
 
 		 481 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  37.07 
 
 		 549 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 		 478 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 438 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  39.64 
 
 		 532 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.79 
 
 		 443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  40.6 
 
 		 439 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.37 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  34.68 
 
 		 479 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  38.18 
 
 		 438 aa  212  7e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 379 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  37.03 
 
 		 472 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.19 
 
 		 455 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 452 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 515 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 515 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 515 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  38.64 
 
 		 524 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.79 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 		 436 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  38.64 
 
 		 524 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  38.64 
 
 		 524 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  38.64 
 
 		 524 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.56 
 
 		 423 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36 
 
 		 428 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  36.34 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  38.64 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  38.64 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 468 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  38.94 
 
 		 521 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 524 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 530 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  34.7 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 410 aa  211  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 		 550 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 		 446 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 515 aa  210  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  34.51 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 		 440 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 427 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.64 
 
 		 450 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 481 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  35.8 
 
 		 538 aa  208  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 511 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 513 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 383 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  36.17 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.01 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  38.32 
 
 		 526 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 		 522 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  36.92 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.89 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.64 
 
 		 439 aa  206  4e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  34.89 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.01 
 
 		 451 aa  206  4e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 		 445 aa  206  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  33.33 
 
 		 480 aa  206  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  37.63 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.84 
 
 		 428 aa  206  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>