More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0287 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
377 aa  754    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  51.83 
 
 
383 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  51.62 
 
 
383 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  55.16 
 
 
392 aa  355  7.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  45.76 
 
 
387 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  44.35 
 
 
379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
395 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  39.57 
 
 
389 aa  278  9e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  41.74 
 
 
476 aa  268  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  44.31 
 
 
443 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  37.37 
 
 
418 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.88 
 
 
441 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  41.45 
 
 
455 aa  261  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  42.86 
 
 
450 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  42.6 
 
 
452 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  39.15 
 
 
398 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.81 
 
 
457 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  43.11 
 
 
445 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 
444 aa  255  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  43.9 
 
 
445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  44.82 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  44.82 
 
 
436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.41 
 
 
443 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  40.58 
 
 
429 aa  253  5.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  41.87 
 
 
455 aa  253  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
438 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
438 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  44.51 
 
 
438 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  43.6 
 
 
439 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  42.55 
 
 
440 aa  251  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  42.47 
 
 
444 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
397 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  44.17 
 
 
438 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 
418 aa  250  3e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  41.09 
 
 
444 aa  250  3e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  42.17 
 
 
426 aa  249  4e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 
444 aa  249  7e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  42.45 
 
 
439 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.34 
 
 
432 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  41.21 
 
 
439 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.29 
 
 
461 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  37.68 
 
 
401 aa  246  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.27 
 
 
446 aa  245  9.999999999999999e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  42.07 
 
 
468 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 
418 aa  243  6e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 
482 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  41.69 
 
 
482 aa  242  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
438 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  43.56 
 
 
429 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  38.73 
 
 
428 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  38.06 
 
 
410 aa  239  5e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 
441 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 
428 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  41.34 
 
 
439 aa  237  2e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 
433 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 
422 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  36.46 
 
 
468 aa  236  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  41.34 
 
 
423 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
478 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
458 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 
430 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 
478 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  40.4 
 
 
429 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
469 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
469 aa  233  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
469 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  38.96 
 
 
439 aa  233  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  37.47 
 
 
476 aa  233  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
478 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
478 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
478 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
478 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 
478 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  38.68 
 
 
427 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  40.33 
 
 
444 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 
472 aa  231  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
457 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 
456 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40 
 
 
462 aa  229  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 
402 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  37.27 
 
 
480 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 
402 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  36.73 
 
 
478 aa  229  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  39.72 
 
 
434 aa  229  9e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 
443 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  39.75 
 
 
428 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.96 
 
 
444 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  42.03 
 
 
456 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
428 aa  227  2e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 
507 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 
415 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  37.76 
 
 
425 aa  227  3e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  40.65 
 
 
445 aa  226  3e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 
400 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
442 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.4 
 
 
423 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  37.11 
 
 
430 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>