More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3264 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
470 aa  959    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  39.66 
 
 
554 aa  249  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 
397 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
443 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
418 aa  212  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  33.82 
 
 
379 aa  209  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.13 
 
 
410 aa  208  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.33 
 
 
429 aa  206  8e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  35.54 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
494 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 
377 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.4 
 
 
482 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.4 
 
 
482 aa  196  6e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 
428 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  32.04 
 
 
515 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 
515 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 
515 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 
515 aa  196  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  32.6 
 
 
511 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  33.14 
 
 
477 aa  196  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  32.32 
 
 
513 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  32 
 
 
530 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  31.7 
 
 
532 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  33.06 
 
 
477 aa  194  4e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  33.33 
 
 
524 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  33.33 
 
 
530 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
530 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  33.33 
 
 
524 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
524 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  33.33 
 
 
524 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  33.33 
 
 
524 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 
496 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 
496 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  33.05 
 
 
521 aa  192  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  32.22 
 
 
515 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  34.03 
 
 
507 aa  192  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  30.99 
 
 
455 aa  192  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
398 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  31.56 
 
 
526 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  31.56 
 
 
522 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 
418 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 
491 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  32.19 
 
 
457 aa  190  4e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  31.86 
 
 
440 aa  190  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  33.05 
 
 
444 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  31.98 
 
 
535 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 
442 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 
478 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
395 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
469 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
478 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
478 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
478 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
478 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
469 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 
429 aa  186  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  33.61 
 
 
484 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  37.03 
 
 
392 aa  186  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
478 aa  186  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 
469 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 
440 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 
422 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  34.93 
 
 
478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  30.19 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
478 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  31.95 
 
 
549 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  30.81 
 
 
447 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 
472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  32.65 
 
 
449 aa  183  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  31.87 
 
 
441 aa  183  7e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  30.58 
 
 
463 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  31.09 
 
 
538 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 
383 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  34.16 
 
 
434 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  33.75 
 
 
401 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  31.66 
 
 
550 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  32.67 
 
 
456 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  30.99 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
438 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
438 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 
423 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  32.39 
 
 
456 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  32.09 
 
 
437 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 
402 aa  179  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 
488 aa  179  8e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 
402 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 
445 aa  179  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
436 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  34.05 
 
 
401 aa  179  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  31.78 
 
 
445 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  29.78 
 
 
440 aa  179  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 
401 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  29.64 
 
 
428 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  34.37 
 
 
401 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  30.29 
 
 
426 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
436 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 
426 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>