More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2904 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 415 aa  831    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  53.99 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 		 398 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 418 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  38.88 
 
 		 397 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 		 428 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 		 428 aa  254  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.39 
 
 		 450 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  36.11 
 
 		 383 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 		 383 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 377 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40.73 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 432 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.7 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 		 456 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  37.22 
 
 		 387 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 		 457 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 458 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.95 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  31.41 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 446 aa  219  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.44 
 
 		 451 aa  219  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  34.72 
 
 		 418 aa  219  6e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 379 aa  219  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  35.73 
 
 		 441 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.35 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  36.69 
 
 		 498 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  31.36 
 
 		 433 aa  216  7e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.05 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 455 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  36.07 
 
 		 425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.16 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 		 496 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  40.58 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 		 452 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  34 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 		 496 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.53 
 
 		 462 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  34.87 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 442 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  33.6 
 
 		 439 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  35.26 
 
 		 479 aa  210  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  35.07 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  40.29 
 
 		 429 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  33.51 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  36.79 
 
 		 478 aa  209  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  35.96 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  35.96 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  35.05 
 
 		 428 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.11 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  35.47 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  34.41 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 		 482 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  34.11 
 
 		 407 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  33.73 
 
 		 427 aa  206  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  35.66 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 478 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 436 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 478 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 418 aa  206  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  36.42 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  34.97 
 
 		 478 aa  206  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 		 410 aa  206  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  34.35 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  37.83 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  37.11 
 
 		 392 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  35.34 
 
 		 479 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 444 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  34.61 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  32.86 
 
 		 445 aa  204  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  34.38 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  34.61 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 438 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  35.53 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  34.1 
 
 		 481 aa  203  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.1 
 
 		 445 aa  203  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  35.87 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 453 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.75 
 
 		 448 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 449 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.75 
 
 		 448 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>