More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1299 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  77.8 
 
 
444 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
449 aa  902    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  75.19 
 
 
453 aa  608  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  62.85 
 
 
450 aa  550  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  58.51 
 
 
434 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  58.51 
 
 
434 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  57.04 
 
 
433 aa  479  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  52.13 
 
 
444 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  52.13 
 
 
444 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  53.76 
 
 
444 aa  472  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  59.08 
 
 
425 aa  468  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  56.24 
 
 
430 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  56 
 
 
430 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  54.27 
 
 
429 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  53.43 
 
 
430 aa  434  1e-120  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  53.63 
 
 
427 aa  433  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  53.81 
 
 
428 aa  431  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  55.21 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  48.43 
 
 
434 aa  370  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
413 aa  364  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  46.32 
 
 
431 aa  362  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 
447 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  48.25 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  45.5 
 
 
446 aa  355  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  45.26 
 
 
407 aa  351  2e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  45.97 
 
 
413 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  45.97 
 
 
413 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 
440 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  44.02 
 
 
440 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  46.09 
 
 
412 aa  336  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  45.08 
 
 
416 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 
434 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 
458 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 
458 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  46.61 
 
 
409 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  43.42 
 
 
410 aa  289  7e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  37.76 
 
 
446 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  38.71 
 
 
457 aa  252  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  38.71 
 
 
436 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  39.23 
 
 
389 aa  250  4e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 
427 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  35.26 
 
 
429 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
394 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 
455 aa  246  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  37.91 
 
 
429 aa  246  8e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 
400 aa  246  9e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 
428 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  40.1 
 
 
418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 
431 aa  243  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 
436 aa  241  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 
397 aa  240  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  39.64 
 
 
426 aa  239  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  40.21 
 
 
452 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.85 
 
 
423 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  43.09 
 
 
440 aa  236  8e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  41.55 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  44.19 
 
 
410 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  44.92 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  40.95 
 
 
451 aa  234  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  39.85 
 
 
433 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  40.83 
 
 
456 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 
458 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  43.42 
 
 
439 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  35.64 
 
 
476 aa  231  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
446 aa  231  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 
444 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  42.11 
 
 
451 aa  231  3e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  41.12 
 
 
452 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
457 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  42.28 
 
 
379 aa  229  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.44 
 
 
443 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.33 
 
 
428 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  39.32 
 
 
401 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  41.92 
 
 
417 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
482 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  37.18 
 
 
444 aa  226  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  42.55 
 
 
444 aa  226  8e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  41.03 
 
 
418 aa  226  8e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 
428 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  43.56 
 
 
438 aa  225  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  39.32 
 
 
402 aa  224  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.07 
 
 
441 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  43.53 
 
 
463 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  39.24 
 
 
457 aa  224  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  44.12 
 
 
444 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.59 
 
 
422 aa  224  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  39.32 
 
 
402 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 
468 aa  224  4e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  43.79 
 
 
438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  43.79 
 
 
438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  43.79 
 
 
438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  42.24 
 
 
444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.61 
 
 
443 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  40.94 
 
 
476 aa  222  9e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  43.42 
 
 
434 aa  222  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  43.69 
 
 
438 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37419  D1 proceesing peptidase  38.33 
 
 
446 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.1 
 
 
450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.63 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>