More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0474 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
392 aa  783    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  53.77 
 
 
383 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  52.37 
 
 
383 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  52.41 
 
 
377 aa  378  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  46.12 
 
 
395 aa  308  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  51.18 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  42.12 
 
 
379 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  43.8 
 
 
398 aa  276  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 
418 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  41.67 
 
 
389 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  45.95 
 
 
445 aa  266  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.04 
 
 
445 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  45.54 
 
 
446 aa  264  2e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.68 
 
 
452 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.72 
 
 
441 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 
438 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  43.17 
 
 
450 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.74 
 
 
443 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.52 
 
 
455 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  43.8 
 
 
438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 
428 aa  252  8.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.71 
 
 
426 aa  252  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.51 
 
 
476 aa  250  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  44.38 
 
 
439 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  41.02 
 
 
444 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 
437 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 
438 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 
438 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  44.04 
 
 
439 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.62 
 
 
432 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.06 
 
 
443 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  43.75 
 
 
440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 
444 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.82 
 
 
457 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  42.25 
 
 
440 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  43.35 
 
 
462 aa  244  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  44.17 
 
 
436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  44.17 
 
 
436 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 
422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.62 
 
 
444 aa  242  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  39.15 
 
 
434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  41.89 
 
 
463 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  38.98 
 
 
423 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  41.11 
 
 
482 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  41.11 
 
 
482 aa  238  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 
550 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 
538 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 
429 aa  236  7e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 
433 aa  235  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 
429 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.73 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  41.62 
 
 
418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  41.47 
 
 
457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  35.22 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  41.18 
 
 
456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  41.62 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  40.26 
 
 
549 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.37 
 
 
423 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 
468 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  41.02 
 
 
451 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 
444 aa  231  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  42.05 
 
 
535 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 
441 aa  231  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  38.21 
 
 
428 aa  231  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  34.04 
 
 
425 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  35.86 
 
 
418 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  38.85 
 
 
444 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  41.49 
 
 
440 aa  231  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
415 aa  230  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  40.88 
 
 
458 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  41.9 
 
 
439 aa  230  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 
438 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 
455 aa  229  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 
410 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  42.14 
 
 
453 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  39.07 
 
 
443 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  41.19 
 
 
532 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 
428 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  40.9 
 
 
440 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  40.73 
 
 
447 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
522 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 
401 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  41.28 
 
 
476 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  40 
 
 
526 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  40.62 
 
 
530 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 
530 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  40.62 
 
 
524 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  42.64 
 
 
415 aa  227  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  40.62 
 
 
524 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  40.62 
 
 
524 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  40.62 
 
 
524 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 
480 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 
447 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 
478 aa  226  4e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  40.62 
 
 
524 aa  226  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  41.24 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  38.18 
 
 
530 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>