More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1930 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 505 aa  1013    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  45.55 
 
 		 497 aa  423  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  43.37 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  33.67 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  30.18 
 
 		 476 aa  222  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  31.49 
 
 		 379 aa  204  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  32.99 
 
 		 410 aa  204  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 		 489 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  32.09 
 
 		 383 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 429 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  28.97 
 
 		 438 aa  199  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  31.09 
 
 		 450 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  31.36 
 
 		 445 aa  196  8.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  30.02 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  31.27 
 
 		 440 aa  193  6e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  31.18 
 
 		 482 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  29.67 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  29.85 
 
 		 429 aa  192  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  36.29 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  36.62 
 
 		 554 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  29.9 
 
 		 443 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  32.98 
 
 		 538 aa  189  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  32.77 
 
 		 383 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 		 392 aa  188  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  30.5 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  30.36 
 
 		 387 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  30.64 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  29.97 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 		 478 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  30.33 
 
 		 443 aa  187  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  30.63 
 
 		 422 aa  187  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 478 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  29.92 
 
 		 441 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 469 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 478 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 478 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 478 aa  187  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  31.13 
 
 		 471 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  31.22 
 
 		 444 aa  186  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  28.99 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  29.5 
 
 		 423 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  31.55 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  30.92 
 
 		 478 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  31.32 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 		 415 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  30.21 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  34.81 
 
 		 439 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  31.02 
 
 		 463 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  30.42 
 
 		 478 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  29.06 
 
 		 434 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  34.6 
 
 		 377 aa  183  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  29.6 
 
 		 456 aa  183  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  29.2 
 
 		 449 aa  183  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  31.78 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  29.5 
 
 		 444 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  28.54 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  31.97 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  30.81 
 
 		 444 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  30.42 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  31.3 
 
 		 447 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 		 445 aa  182  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  29.58 
 
 		 440 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  26.89 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  29.79 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  29.53 
 
 		 443 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  29.27 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  35.59 
 
 		 377 aa  181  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 		 458 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  29.43 
 
 		 452 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  29.18 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  28.96 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  30.42 
 
 		 468 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  29.98 
 
 		 491 aa  179  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  32.98 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  30 
 
 		 428 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  29.13 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  29.18 
 
 		 456 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 		 427 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 		 424 aa  178  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  27.9 
 
 		 444 aa  178  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  29.68 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  29.98 
 
 		 475 aa  177  3e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 458 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 		 455 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>