More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0168 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  100 
 
 		 564 aa  1155    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 554 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  35.24 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 429 aa  183  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 		 377 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  37.34 
 
 		 430 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  36.14 
 
 		 427 aa  180  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  35.94 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  34.87 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 		 484 aa  171  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 398 aa  170  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  33.82 
 
 		 470 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  33.13 
 
 		 379 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  32.31 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  32.31 
 
 		 482 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 430 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  32.24 
 
 		 476 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  31.88 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  33.43 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 		 413 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 		 413 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  31.92 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 471 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  30.54 
 
 		 383 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  31.19 
 
 		 441 aa  161  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  33.64 
 
 		 434 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  30.91 
 
 		 407 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  33.64 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  32.41 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  33.13 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  31.55 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  31.55 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  32.86 
 
 		 412 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  30.29 
 
 		 432 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  33.13 
 
 		 491 aa  158  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 413 aa  158  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 		 449 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  31.87 
 
 		 444 aa  158  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  29.8 
 
 		 475 aa  157  5.0000000000000005e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  29.27 
 
 		 488 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  32.32 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  32.73 
 
 		 560 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  33.44 
 
 		 450 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  32.32 
 
 		 526 aa  157  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  31.65 
 
 		 445 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  32.6 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  29.85 
 
 		 477 aa  156  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  32.06 
 
 		 428 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 400 aa  155  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  29.11 
 
 		 448 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  31.73 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  29.64 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  32.05 
 
 		 515 aa  154  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  33.83 
 
 		 428 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 		 453 aa  154  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  29.34 
 
 		 478 aa  154  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  31.96 
 
 		 530 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  31.55 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  31.55 
 
 		 445 aa  153  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  30.94 
 
 		 444 aa  153  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  30.93 
 
 		 433 aa  153  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  31.12 
 
 		 445 aa  153  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  33.04 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  32.05 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  33.87 
 
 		 453 aa  153  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  29.76 
 
 		 440 aa  153  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  32.83 
 
 		 417 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 515 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  30.66 
 
 		 515 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  29.91 
 
 		 387 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  32.54 
 
 		 429 aa  151  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  30.95 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  29.52 
 
 		 439 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 513 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  31.51 
 
 		 511 aa  151  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  32.14 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  30.65 
 
 		 428 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  32.51 
 
 		 521 aa  150  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  31.03 
 
 		 440 aa  149  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  33.53 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  32.5 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  30.39 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.22 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  32.17 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  31.56 
 
 		 480 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  33.63 
 
 		 409 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  31.96 
 
 		 431 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  30.86 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  29.94 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  30.79 
 
 		 472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  31.68 
 
 		 530 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>