More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0290 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
488 aa  984    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  43.37 
 
 
505 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  42.14 
 
 
497 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  35.21 
 
 
472 aa  270  5e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  33.26 
 
 
480 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  32.74 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  28.29 
 
 
476 aa  221  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  33.48 
 
 
478 aa  220  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 
418 aa  216  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  35.64 
 
 
379 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  32.19 
 
 
383 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 
438 aa  212  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
478 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
478 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  30.47 
 
 
478 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
469 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
478 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  32.22 
 
 
463 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
469 aa  207  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
469 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  30.47 
 
 
478 aa  207  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  32.41 
 
 
478 aa  207  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  31.76 
 
 
429 aa  206  7e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  30.06 
 
 
478 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
442 aa  203  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  32 
 
 
443 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 
398 aa  201  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  33.06 
 
 
456 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  34.21 
 
 
424 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  34.21 
 
 
424 aa  197  3e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 
438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  34.57 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 
438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
401 aa  196  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  34.96 
 
 
438 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  31.33 
 
 
491 aa  196  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  34.47 
 
 
445 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  32.82 
 
 
433 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  31.99 
 
 
458 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 
452 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 
437 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
423 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
422 aa  194  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 
418 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
428 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  31.76 
 
 
445 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  31.3 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 
377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  33.71 
 
 
439 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  32.49 
 
 
444 aa  189  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  32.29 
 
 
447 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  33.09 
 
 
475 aa  188  1e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  33.58 
 
 
401 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 
496 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  32.6 
 
 
444 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  32.05 
 
 
440 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 
496 aa  187  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  32.2 
 
 
471 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  32.32 
 
 
439 aa  187  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  30.63 
 
 
432 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 
455 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  29.43 
 
 
383 aa  186  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  33.14 
 
 
439 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  36.68 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  31.14 
 
 
446 aa  184  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
436 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 
563 aa  184  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
436 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  31.56 
 
 
440 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  32.99 
 
 
401 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  32.86 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 
446 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 
439 aa  182  1e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 
444 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  32.01 
 
 
461 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 
429 aa  182  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 
440 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  31.85 
 
 
428 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  29.49 
 
 
462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  31.93 
 
 
426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  31.46 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  29.4 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  33.43 
 
 
417 aa  179  7e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 
428 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  32.34 
 
 
428 aa  179  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  30.05 
 
 
457 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 
458 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  30.13 
 
 
434 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  31.19 
 
 
439 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 
444 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  31.93 
 
 
427 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  33.84 
 
 
415 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 
494 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  30.61 
 
 
451 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 
401 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  34.54 
 
 
444 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  29.56 
 
 
452 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  32.27 
 
 
418 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>