More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0877 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 417 aa  810    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  41.56 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  40.39 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  43.73 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  41.72 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  34.22 
 
 		 491 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.9 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.82 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  36 
 
 		 472 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  41.01 
 
 		 407 aa  223  7e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.63 
 
 		 452 aa  222  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  36.77 
 
 		 389 aa  222  9e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.76 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  32.51 
 
 		 410 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.21 
 
 		 433 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  38.08 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  38.04 
 
 		 387 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  32.96 
 
 		 444 aa  218  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.75 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  39.65 
 
 		 425 aa  216  4e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.33 
 
 		 461 aa  217  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.66 
 
 		 443 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.64 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.64 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  36.87 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.58 
 
 		 445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  39.88 
 
 		 444 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37.58 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.31 
 
 		 428 aa  212  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  37.05 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  39.22 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  36.36 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  39.22 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 494 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 489 aa  207  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 430 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.76 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 		 434 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 471 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.63 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 		 409 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  40.31 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.86 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  31.73 
 
 		 435 aa  203  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  32.68 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 		 444 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 		 398 aa  203  6e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 446 aa  202  6e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  31.87 
 
 		 441 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  35.01 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  33.54 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 		 428 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  34.15 
 
 		 439 aa  201  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 456 aa  201  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  33.97 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  33.23 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.79 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 428 aa  199  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  34.68 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  36.98 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 476 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  35.19 
 
 		 444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  36.98 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  34.01 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 530 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  36.75 
 
 		 521 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  36.53 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 447 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  37.04 
 
 		 524 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  37.04 
 
 		 524 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 530 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 524 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  34.34 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>