More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0224 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 401 aa  805    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  56.58 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  56.32 
 
 		 402 aa  419  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  52.51 
 
 		 379 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  41.79 
 
 		 426 aa  306  3e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  41.02 
 
 		 427 aa  260  4e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 429 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  40.3 
 
 		 418 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  40.24 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  44.44 
 
 		 410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 430 aa  252  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  41.83 
 
 		 461 aa  252  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.86 
 
 		 428 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  40.88 
 
 		 400 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  39.1 
 
 		 476 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  42.57 
 
 		 445 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  42.57 
 
 		 445 aa  243  6e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  40.66 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  45.95 
 
 		 441 aa  242  7e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  41.43 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  40.78 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.04 
 
 		 440 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  37.8 
 
 		 430 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  38.89 
 
 		 445 aa  236  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 		 438 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.02 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 446 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.33 
 
 		 434 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  38.44 
 
 		 435 aa  233  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  43.59 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  41.08 
 
 		 444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 379 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  40.88 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 		 433 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  42.41 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  42.17 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  41.72 
 
 		 482 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  41.72 
 
 		 482 aa  229  5e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 		 468 aa  229  7e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  42.35 
 
 		 440 aa  229  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  42.35 
 
 		 440 aa  229  8e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.8 
 
 		 444 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  40.53 
 
 		 426 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  39.53 
 
 		 444 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  39.32 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 481 aa  227  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  41.88 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  43.35 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.72 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.53 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.41 
 
 		 432 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  40.73 
 
 		 483 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  39.74 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  36.91 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  41.99 
 
 		 444 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  40.5 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  38.68 
 
 		 480 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.21 
 
 		 439 aa  224  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 437 aa  223  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.41 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.81 
 
 		 443 aa  222  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 		 444 aa  222  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  37.6 
 
 		 457 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.52 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  39.7 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  39.37 
 
 		 462 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 		 463 aa  222  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  39.61 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.73 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  42.17 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  40.17 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 476 aa  220  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 472 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  39.61 
 
 		 444 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 453 aa  219  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  37.83 
 
 		 413 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 		 428 aa  219  6e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 		 447 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  37.83 
 
 		 413 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  39.12 
 
 		 455 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  40.52 
 
 		 444 aa  219  8.999999999999998e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  41.4 
 
 		 455 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  38.26 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  39.62 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  35.96 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  35.98 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  38.26 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.19 
 
 		 419 aa  217  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.68 
 
 		 443 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  34.22 
 
 		 401 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>