More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0582 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 423 aa  837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  87.94 
 
 		 423 aa  751    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  48.9 
 
 		 421 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  41.94 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 377 aa  245  9e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  41.36 
 
 		 377 aa  243  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  38.87 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 377 aa  239  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 379 aa  236  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  42.43 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 		 418 aa  229  8e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.79 
 
 		 443 aa  227  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  31.28 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.11 
 
 		 450 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  31.54 
 
 		 482 aa  224  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  32.77 
 
 		 444 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  37.95 
 
 		 387 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 433 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.53 
 
 		 441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 		 438 aa  220  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 496 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 496 aa  219  7e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 		 476 aa  219  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  33.69 
 
 		 443 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.12 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.45 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.06 
 
 		 455 aa  216  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  34.83 
 
 		 489 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 		 468 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.89 
 
 		 446 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.91 
 
 		 410 aa  216  8e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 479 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  36.92 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  34.66 
 
 		 462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 479 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 432 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.88 
 
 		 426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  36.44 
 
 		 479 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 		 484 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  36.57 
 
 		 440 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.23 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  35.41 
 
 		 480 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  34 
 
 		 438 aa  212  9e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 		 441 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  34.76 
 
 		 457 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  35.14 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  37.08 
 
 		 481 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.11 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  34.75 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  35.79 
 
 		 478 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  34.76 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.8 
 
 		 434 aa  210  3e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  35.79 
 
 		 478 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.27 
 
 		 444 aa  210  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  33.43 
 
 		 400 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 429 aa  209  5e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  34.13 
 
 		 457 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 		 444 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  35.58 
 
 		 549 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  33.06 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.73 
 
 		 453 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  39.4 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  33.71 
 
 		 435 aa  207  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  36.07 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  35.76 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  32.89 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 		 482 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  33.16 
 
 		 482 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 515 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 		 438 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  34.93 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  31.45 
 
 		 478 aa  206  8e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  34.27 
 
 		 491 aa  206  9e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 445 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 		 438 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  32.02 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  33.84 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  35.67 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  35.36 
 
 		 498 aa  205  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  31.39 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  37.38 
 
 		 446 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  31.84 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  34.62 
 
 		 451 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 556 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  36.05 
 
 		 515 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 		 442 aa  205  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 		 483 aa  204  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>