More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1420 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  70.45 
 
 
438 aa  642    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
440 aa  885    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  45.31 
 
 
449 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 
423 aa  220  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  40.71 
 
 
418 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
397 aa  216  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 
383 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  34.76 
 
 
455 aa  208  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 
438 aa  206  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  37.09 
 
 
387 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 
418 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  38.26 
 
 
472 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  33.87 
 
 
400 aa  203  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
423 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
476 aa  202  8e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.94 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.17 
 
 
452 aa  196  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  41 
 
 
449 aa  196  9e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
423 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 
441 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.21 
 
 
444 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  36.06 
 
 
383 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  36.61 
 
 
426 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  32.37 
 
 
444 aa  194  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  32.51 
 
 
444 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.8 
 
 
450 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  34.25 
 
 
443 aa  193  6e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 
429 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.33 
 
 
429 aa  192  8e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  33.97 
 
 
443 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.41 
 
 
457 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  39.56 
 
 
407 aa  192  1e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 
453 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  38.29 
 
 
417 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.52 
 
 
433 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  37.13 
 
 
461 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 
446 aa  190  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  31.6 
 
 
455 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
444 aa  190  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 
443 aa  189  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  38.91 
 
 
409 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  39.46 
 
 
453 aa  189  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  34.32 
 
 
442 aa  189  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 
432 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 
560 aa  189  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 
456 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 
484 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 
418 aa  187  4e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 
494 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 
377 aa  187  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 
428 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 
468 aa  186  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  36.04 
 
 
489 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 
439 aa  186  7e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  35.24 
 
 
444 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  34.7 
 
 
458 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 
444 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  37.83 
 
 
412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  34.32 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  34.32 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  35.93 
 
 
482 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.83 
 
 
438 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 
482 aa  184  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  34.23 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 
402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 
438 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 
438 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  34.95 
 
 
445 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  34.25 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.04 
 
 
428 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
463 aa  182  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 
449 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 
415 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 
392 aa  182  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  33.94 
 
 
440 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  31.04 
 
 
440 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  36.46 
 
 
445 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  36.46 
 
 
445 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  34.71 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.05 
 
 
448 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  30.82 
 
 
440 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.05 
 
 
448 aa  180  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  37.87 
 
 
425 aa  180  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.24 
 
 
410 aa  180  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  39.07 
 
 
413 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.06 
 
 
444 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 
401 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 
422 aa  179  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 
478 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  34.81 
 
 
434 aa  179  8e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  34.01 
 
 
444 aa  179  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 
401 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
416 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  37.22 
 
 
444 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>