More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0408 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  70.45 
 
 		 440 aa  642    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 438 aa  874    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 		 449 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  36.73 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.95 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  34.82 
 
 		 383 aa  212  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  35.38 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 		 397 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  34.78 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  36.54 
 
 		 494 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  37.47 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 		 455 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  32.23 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  35.2 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  38.59 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.64 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.43 
 
 		 441 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.5 
 
 		 441 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 440 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  35.5 
 
 		 476 aa  197  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  39.53 
 
 		 463 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.8 
 
 		 439 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 		 458 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 		 456 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  37.44 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  36.13 
 
 		 440 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 432 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.58 
 
 		 444 aa  193  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.37 
 
 		 438 aa  193  7e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  33.87 
 
 		 472 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  34.91 
 
 		 434 aa  192  9e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.44 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  39.06 
 
 		 413 aa  192  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.81 
 
 		 443 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  36.92 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  37.23 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  36.73 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  34.93 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  37.37 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  35.07 
 
 		 444 aa  191  2.9999999999999997e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.37 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  36.31 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  36.31 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 443 aa  190  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  29.66 
 
 		 475 aa  189  8e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.77 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 		 429 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 		 446 aa  189  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 451 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.92 
 
 		 444 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  35.54 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  34.63 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  38.3 
 
 		 429 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.64 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  35.4 
 
 		 427 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  37 
 
 		 412 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  34.36 
 
 		 400 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  36.33 
 
 		 417 aa  187  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 421 aa  186  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 		 444 aa  186  7e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 		 413 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  36.63 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  33.13 
 
 		 480 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  35.7 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  36.91 
 
 		 434 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  38.06 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  38.17 
 
 		 457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  38.46 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  35.43 
 
 		 447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  36.58 
 
 		 434 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  36.94 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  35.33 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  31.67 
 
 		 416 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 434 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 		 444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  36.21 
 
 		 444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  31.77 
 
 		 415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.61 
 
 		 455 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 		 445 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  35.22 
 
 		 430 aa  182  8.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>