More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1479 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
449 aa  905    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
438 aa  354  2e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  44.82 
 
 
440 aa  349  5e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 
383 aa  209  9e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 
418 aa  206  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 
397 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 
423 aa  202  7e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  34.9 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  35.32 
 
 
383 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  37.12 
 
 
377 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  34.78 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  36.56 
 
 
387 aa  196  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.41 
 
 
433 aa  196  9e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 
449 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 
438 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 
438 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  33.51 
 
 
401 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  36.73 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 
438 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  37.31 
 
 
439 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  35.84 
 
 
494 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 
455 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  35.91 
 
 
426 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 
463 aa  187  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  31.51 
 
 
475 aa  186  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 
439 aa  186  6e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  35.83 
 
 
401 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  36.94 
 
 
445 aa  186  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  34.7 
 
 
443 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 
441 aa  186  9e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  35.35 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.31 
 
 
445 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  36.17 
 
 
498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
436 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  33.49 
 
 
441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  37.39 
 
 
436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  39.13 
 
 
453 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  34.2 
 
 
440 aa  183  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  34.79 
 
 
443 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.99 
 
 
450 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  34.74 
 
 
482 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  34.74 
 
 
482 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  35.15 
 
 
489 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
442 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 
430 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 
395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  34.38 
 
 
472 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  34.93 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  35.67 
 
 
389 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  35.8 
 
 
429 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 
444 aa  179  8e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 
484 aa  179  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
430 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  31.53 
 
 
444 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  33.95 
 
 
491 aa  178  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  34.6 
 
 
439 aa  178  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  34.16 
 
 
443 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 
560 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 
507 aa  178  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  33.17 
 
 
461 aa  177  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 
410 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  38.76 
 
 
428 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 
442 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 
413 aa  177  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  34.76 
 
 
444 aa  177  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 
423 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  39.47 
 
 
427 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.91 
 
 
476 aa  176  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
458 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  35.34 
 
 
424 aa  176  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
458 aa  176  9e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  35.34 
 
 
424 aa  176  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 
446 aa  176  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.45 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 
453 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
452 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  37.38 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  33.91 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  34.35 
 
 
468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 
402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  32.54 
 
 
476 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  38.54 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  36.34 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  34.88 
 
 
379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  33.68 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  31.54 
 
 
457 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  38.28 
 
 
450 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  35.63 
 
 
389 aa  173  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 
417 aa  173  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  32.54 
 
 
444 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.23 
 
 
438 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 
436 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 
463 aa  172  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  34.76 
 
 
456 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  37.42 
 
 
430 aa  172  7.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 
440 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>