More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3700 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 401 aa  820    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  57.5 
 
 		 401 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  56.42 
 
 		 401 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  55.92 
 
 		 401 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  57.14 
 
 		 401 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  55.92 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  55.67 
 
 		 401 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  54.36 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  55.92 
 
 		 401 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  56.68 
 
 		 401 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  56.17 
 
 		 401 aa  441  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  56.17 
 
 		 401 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  56.6 
 
 		 402 aa  435  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  55.92 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  55.11 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.17 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.19 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.19 
 
 		 452 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 		 440 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 		 440 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.64 
 
 		 457 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 445 aa  265  1e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  41.03 
 
 		 437 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 444 aa  262  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.03 
 
 		 451 aa  261  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 		 446 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  35.98 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  39.51 
 
 		 444 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.43 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 		 432 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 		 458 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.43 
 
 		 438 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 		 440 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  40.43 
 
 		 438 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  40.8 
 
 		 440 aa  259  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.82 
 
 		 445 aa  258  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  35.75 
 
 		 428 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.94 
 
 		 445 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  39.64 
 
 		 440 aa  257  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  38.25 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 		 440 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 		 440 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.85 
 
 		 439 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  36.63 
 
 		 435 aa  255  8e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  39.22 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.01 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  36.19 
 
 		 443 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.46 
 
 		 423 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 		 447 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  38.38 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.81 
 
 		 429 aa  251  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  37.08 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  37.06 
 
 		 471 aa  251  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  35.86 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.77 
 
 		 453 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.41 
 
 		 444 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  39.45 
 
 		 424 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  38.23 
 
 		 462 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 448 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  37.57 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  37.5 
 
 		 462 aa  249  6e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  37.94 
 
 		 449 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  39.45 
 
 		 424 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 		 498 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 444 aa  246  6e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  36.44 
 
 		 482 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 		 482 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  39.05 
 
 		 445 aa  245  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.31 
 
 		 434 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  38.2 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  38.57 
 
 		 434 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.6 
 
 		 439 aa  243  3.9999999999999997e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.49 
 
 		 439 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 439 aa  243  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.68 
 
 		 443 aa  242  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.63 
 
 		 441 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  37.32 
 
 		 472 aa  242  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 455 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 		 468 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  36.52 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.22 
 
 		 443 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  38.01 
 
 		 439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 		 415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  37.91 
 
 		 436 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  35.39 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.28 
 
 		 438 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 507 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  36.8 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.57 
 
 		 444 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>