More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1732 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  100 
 
 		 497 aa  1013    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 		 505 aa  425  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  32.39 
 
 		 472 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  30.47 
 
 		 476 aa  209  8e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  35.09 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  32.02 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  29.72 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  29.72 
 
 		 496 aa  191  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  34.06 
 
 		 383 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  29.56 
 
 		 478 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 		 478 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  29.65 
 
 		 478 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 469 aa  183  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  29.44 
 
 		 469 aa  183  7e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 		 452 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  30.55 
 
 		 383 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  32.88 
 
 		 429 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  28.81 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  29 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  30.75 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  30.92 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 		 494 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  29 
 
 		 478 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 		 480 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  30.66 
 
 		 445 aa  176  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  32.32 
 
 		 443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  30.47 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  32.22 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  30.67 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  32.32 
 
 		 444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 		 489 aa  173  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  29.16 
 
 		 442 aa  173  5e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  31.71 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 		 429 aa  172  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  31.58 
 
 		 444 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  30.2 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.6 
 
 		 564 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  28.68 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  30.43 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 		 440 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  31.62 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  30.2 
 
 		 424 aa  170  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  31.19 
 
 		 440 aa  169  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  29.53 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  31.44 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  29.34 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  30.08 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  30.16 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 		 448 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  28.92 
 
 		 451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  32.49 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  28.05 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  32.49 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  30.66 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  29.58 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 		 461 aa  166  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  29.38 
 
 		 397 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 560 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  30.13 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  29.92 
 
 		 444 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  29.52 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  31.37 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  31.61 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  30.49 
 
 		 445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  29.21 
 
 		 471 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  29.02 
 
 		 475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  31.55 
 
 		 428 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  30.79 
 
 		 468 aa  163  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  28.4 
 
 		 441 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  29.13 
 
 		 451 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  31.12 
 
 		 569 aa  163  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  31.69 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 		 444 aa  163  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 440 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 440 aa  163  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  32.87 
 
 		 438 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  32.87 
 
 		 437 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  32.87 
 
 		 438 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  30.05 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  30.79 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  29.09 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  32.22 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>