19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2484 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  976    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  23.43 
 
 		 443 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  22.78 
 
 		 503 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  24.48 
 
 		 596 aa  96.7  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  22.87 
 
 		 791 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6149  peptidase S41  24.27 
 
 		 513 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  23.25 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  20.87 
 
 		 494 aa  61.6  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  22.97 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0724  hypothetical protein  28.09 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.754516  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  21.83 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  21.65 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1495  S41 family peptidase  28 
 
 		 365 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0882009  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  26.85 
 
 		 475 aa  47.4  0.0006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  24.31 
 
 		 446 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  27.22 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0730  peptidase S41  20.94 
 
 		 423 aa  45.1  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>