14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5254 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  100 
 
 		 503 aa  1041    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6149  peptidase S41  26.57 
 
 		 513 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  22.78 
 
 		 476 aa  107  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  23.6 
 
 		 596 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  24.28 
 
 		 443 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  21.65 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  20.62 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  21.49 
 
 		 491 aa  60.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  21.69 
 
 		 791 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0730  peptidase S41  22.86 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  16.95 
 
 		 494 aa  50.1  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1495  S41 family peptidase  27.64 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0882009  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  28.83 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0248  hypothetical protein  23.12 
 
 		 601 aa  43.5  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.606779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>