69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1099 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  100 
 
 
428 aa  864    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  51.8 
 
 
494 aa  472  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0557  peptidase S41  26.25 
 
 
467 aa  167  4e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  20.62 
 
 
503 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  20.9 
 
 
491 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  30.61 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  30.1 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  22.97 
 
 
476 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  20.85 
 
 
443 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  22.87 
 
 
725 aa  54.7  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  23.02 
 
 
596 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  22.65 
 
 
719 aa  52.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  20.44 
 
 
473 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  30.59 
 
 
649 aa  51.6  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 
705 aa  50.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  26.14 
 
 
490 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  23.08 
 
 
445 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  29.51 
 
 
683 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  25.33 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 
428 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  30 
 
 
705 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  28.46 
 
 
697 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  22.03 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  24.09 
 
 
445 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2146  C-terminal processing peptidase-1  28.03 
 
 
712 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.19614 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 
737 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  24.85 
 
 
726 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  27.44 
 
 
737 aa  47  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0218  hypothetical protein  20.58 
 
 
426 aa  46.6  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  24.44 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  23.28 
 
 
447 aa  46.2  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 
721 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  28.96 
 
 
672 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  22.87 
 
 
727 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 
491 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  28.67 
 
 
682 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35170  C-terminal peptidase, S41A subfamily  28.42 
 
 
693 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.422257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  28.67 
 
 
682 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  28.67 
 
 
680 aa  44.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  21.92 
 
 
727 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  28.67 
 
 
680 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  28.67 
 
 
682 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0594829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 
682 aa  44.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  28.67 
 
 
682 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  28.67 
 
 
682 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  29.33 
 
 
692 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  29.33 
 
 
690 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  28.67 
 
 
682 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  30 
 
 
698 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 
426 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
469 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  24.69 
 
 
434 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
469 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 
547 aa  43.5  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  26.53 
 
 
683 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
478 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0121  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 
706 aa  43.5  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
478 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
478 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  32.21 
 
 
478 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  28.41 
 
 
688 aa  43.1  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  25.46 
 
 
438 aa  43.1  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  30 
 
 
671 aa  43.1  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  30 
 
 
682 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  30 
 
 
682 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf456  conserved hypothetical lipoprotein  25 
 
 
665 aa  43.1  0.01  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  23.49 
 
 
401 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>