70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0408 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  100 
 
 		 494 aa  980    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  51.59 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0557  peptidase S41  24.42 
 
 		 467 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  27.11 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  21.33 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  20.87 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0309  carboxyl-terminal protease  27.66 
 
 		 737 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0982282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0282  C-terminal processing peptidase-1  27.66 
 
 		 737 aa  53.9  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.610921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  22.37 
 
 		 473 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf456  conserved hypothetical lipoprotein  25.97 
 
 		 665 aa  51.2  0.00005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000320203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  27.74 
 
 		 668 aa  50.4  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  16.95 
 
 		 503 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  25.55 
 
 		 664 aa  50.1  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3441  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 725 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0836072  normal  0.132534 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  27.72 
 
 		 439 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1106  carboxyl-terminal protease  22.07 
 
 		 727 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  20.41 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6149  peptidase S41  21.39 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0218  hypothetical protein  22.75 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1200  C-terminal processing peptidase  22.07 
 
 		 727 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.573816  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1152  carboxyl-terminal protease  25.47 
 
 		 683 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2400  carboxy-terminal protease  25.68 
 
 		 682 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1988  carboxy-terminal protease  25.68 
 
 		 698 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  28.67 
 
 		 507 aa  47.4  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  25.14 
 
 		 671 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  24.5 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  25.14 
 
 		 671 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1357  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 680 aa  47  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000834708  normal  0.174046 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04290  tail-specific protease  22.07 
 
 		 719 aa  47  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2098  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000592203  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2563  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 680 aa  47  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000036056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5898  carboxyl-terminal protease  24.19 
 
 		 705 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01789  hypothetical protein  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0912  periplasmic protease  28.92 
 
 		 482 aa  47  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2059  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028938  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01801  carboxy-terminal protease for penicillin-binding protein 3  24.04 
 
 		 682 aa  47  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1470  carboxy-terminal protease  25.14 
 
 		 682 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0690257  normal  0.257685 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1286  carboxy-terminal protease  25.14 
 
 		 682 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000018564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1984  carboxy-terminal protease  25.14 
 
 		 682 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00711922  hitchhiker  0.00523275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  26.23 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  26.23 
 
 		 690 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0315  carboxyl-terminal protease  22.89 
 
 		 735 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144056  hitchhiker  0.0000288236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2046  carboxy-terminal protease  25.14 
 
 		 682 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4122  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 697 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  24.04 
 
 		 678 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5403  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 		 705 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 535 aa  44.7  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 721 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  26.83 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  26.78 
 
 		 689 aa  44.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  25.2 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  25.33 
 
 		 525 aa  44.3  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1451  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.31 
 
 		 648 aa  43.9  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1631  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 748 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  26.28 
 
 		 482 aa  43.5  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 469 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 478 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 469 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0166  carboxyl-terminal protease  25.5 
 
 		 726 aa  43.5  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>