More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6647 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  100 
 
 
488 aa  972    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  49.12 
 
 
472 aa  414  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  44.57 
 
 
452 aa  296  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  39.36 
 
 
509 aa  269  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  26.79 
 
 
418 aa  99  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  24.51 
 
 
472 aa  97.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 
446 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.06 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.5 
 
 
442 aa  91.3  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 
398 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  27.92 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  25.19 
 
 
427 aa  83.2  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  26.39 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  27.92 
 
 
482 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  28.45 
 
 
483 aa  82.4  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  27.7 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  30 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  26.22 
 
 
428 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  27.83 
 
 
437 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  27.48 
 
 
440 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  26.65 
 
 
470 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.63 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  28.03 
 
 
482 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 
496 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  28.85 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  23.46 
 
 
383 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  23.91 
 
 
496 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  26.94 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  27.52 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  28.85 
 
 
566 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 
428 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  26.49 
 
 
547 aa  77  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 
416 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  28.99 
 
 
507 aa  76.6  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  24.43 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  25.83 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  30.52 
 
 
555 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  27.13 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  26.58 
 
 
455 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  23.44 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 
478 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  23.48 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  26.32 
 
 
526 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 
522 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  26.08 
 
 
409 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  21.72 
 
 
463 aa  73.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  26.9 
 
 
444 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 
530 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 
478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  24.76 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  27.25 
 
 
444 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  26.8 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
484 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  25.48 
 
 
432 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  24.06 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 
515 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  26.77 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3916  carboxyl-terminal protease  24.27 
 
 
1081 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708032  normal  0.35207 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  27.39 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  28.09 
 
 
551 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 
511 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  28.31 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  28.3 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  27.19 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.7 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  23.42 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  21.69 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  26.77 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  26.09 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.29 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  27.14 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  27.95 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  25.3 
 
 
401 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>