More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0838 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  100 
 
 
452 aa  896    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  48.13 
 
 
472 aa  335  9e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  39.87 
 
 
509 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  44.47 
 
 
488 aa  294  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  29.03 
 
 
1082 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  32.39 
 
 
401 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  32.39 
 
 
401 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  32.69 
 
 
417 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  31.98 
 
 
401 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  29.24 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  29.24 
 
 
401 aa  97.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  28.74 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  28.95 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  29.28 
 
 
402 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  28.95 
 
 
401 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  28.42 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  30.46 
 
 
483 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  30.08 
 
 
472 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  27.82 
 
 
482 aa  91.3  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  30.14 
 
 
415 aa  90.5  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  30.73 
 
 
446 aa  88.6  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  29.6 
 
 
457 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  28.69 
 
 
465 aa  88.2  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.64 
 
 
418 aa  87  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  27.38 
 
 
395 aa  86.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  28.06 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  27.71 
 
 
442 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  28.57 
 
 
1090 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  34.58 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  26.85 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  27.85 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  30.74 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.3 
 
 
440 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  29.13 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 
472 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  30.52 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  30.96 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  26.76 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  28.78 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  30.28 
 
 
427 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  30.03 
 
 
437 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  29.12 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  29.74 
 
 
437 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 
496 aa  77.4  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 
470 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4232  carboxyl-terminal protease  28.35 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  30.25 
 
 
445 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 
530 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  28.11 
 
 
521 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  28.97 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 
488 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  29.39 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  29.14 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  27.22 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  27.8 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  27.58 
 
 
450 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  28.74 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 
436 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  31.8 
 
 
438 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  27.3 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  27.3 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  27.3 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  27.3 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  27.3 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  27.3 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  27.3 
 
 
524 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  28.38 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  28.33 
 
 
453 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  27.63 
 
 
547 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 
410 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  29.87 
 
 
482 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  27.35 
 
 
675 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  29.87 
 
 
482 aa  73.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  28.47 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  28.47 
 
 
458 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 
515 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  29.75 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  27.54 
 
 
515 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  30.33 
 
 
490 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 
515 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 
515 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  29.45 
 
 
481 aa  72  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  31.04 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  27.84 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  28 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  28.38 
 
 
526 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  28.38 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>