More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3153 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  40.29 
 
 		 1097 aa  756    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  100 
 
 		 1090 aa  2232    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  79 
 
 		 1082 aa  1769    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  32.71 
 
 		 1067 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.01 
 
 		 1167 aa  357  5e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  26.04 
 
 		 1079 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.04 
 
 		 1076 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  26.9 
 
 		 1125 aa  313  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25.34 
 
 		 1084 aa  310  1.0000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1059 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  28.95 
 
 		 1089 aa  300  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.43 
 
 		 1075 aa  290  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  27.22 
 
 		 1104 aa  279  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  27.65 
 
 		 1117 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  25.02 
 
 		 1092 aa  257  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  25.62 
 
 		 1084 aa  239  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  24 
 
 		 1094 aa  239  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  23.74 
 
 		 1094 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  23.43 
 
 		 1094 aa  234  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  24.54 
 
 		 1097 aa  234  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  23.35 
 
 		 1094 aa  233  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  23.37 
 
 		 1093 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  23.12 
 
 		 1093 aa  232  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  23.28 
 
 		 1093 aa  231  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  22.91 
 
 		 1094 aa  230  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  23.17 
 
 		 1094 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  27.56 
 
 		 1193 aa  221  7.999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  23.99 
 
 		 1104 aa  219  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  23.32 
 
 		 1094 aa  213  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  26.33 
 
 		 1107 aa  211  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  23.38 
 
 		 1094 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1051 aa  200  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  24.54 
 
 		 1183 aa  197  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  32.31 
 
 		 1016 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  32.72 
 
 		 1069 aa  167  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  30.69 
 
 		 1065 aa  166  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  27.12 
 
 		 1181 aa  166  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  31.06 
 
 		 1186 aa  139  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  29.16 
 
 		 1147 aa  136  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  28.5 
 
 		 428 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  28.43 
 
 		 1008 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  27.29 
 
 		 425 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  24.17 
 
 		 1354 aa  128  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  29.7 
 
 		 482 aa  123  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  24.76 
 
 		 1005 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  26.12 
 
 		 427 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  26.17 
 
 		 1042 aa  112  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  27.27 
 
 		 1059 aa  112  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  26.28 
 
 		 1066 aa  110  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  29.1 
 
 		 483 aa  110  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.63 
 
 		 1040 aa  108  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  26.02 
 
 		 1484 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  24.47 
 
 		 1081 aa  106  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  26.35 
 
 		 1010 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  24.63 
 
 		 590 aa  105  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1042 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  25.36 
 
 		 1062 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.39 
 
 		 1065 aa  102  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  25.59 
 
 		 1062 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  24.33 
 
 		 1069 aa  102  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  26.81 
 
 		 1031 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  26.05 
 
 		 1060 aa  102  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  34.29 
 
 		 572 aa  101  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  24.26 
 
 		 1067 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  25.35 
 
 		 1062 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  24.19 
 
 		 1062 aa  100  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.52 
 
 		 567 aa  100  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  28.82 
 
 		 432 aa  99.8  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  26.42 
 
 		 389 aa  99.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  24.4 
 
 		 717 aa  98.6  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  24.71 
 
 		 1062 aa  98.2  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.88 
 
 		 1062 aa  97.8  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  28.79 
 
 		 457 aa  97.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  24.48 
 
 		 1062 aa  97.1  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  26 
 
 		 1062 aa  96.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  24.24 
 
 		 1062 aa  95.9  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  24.14 
 
 		 1049 aa  95.1  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.3 
 
 		 465 aa  95.1  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.27 
 
 		 1071 aa  93.2  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  27.22 
 
 		 445 aa  92.4  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0612  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.1 
 
 		 590 aa  92.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  25.34 
 
 		 1014 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  30.45 
 
 		 445 aa  89  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  30.64 
 
 		 426 aa  88.6  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  29.34 
 
 		 443 aa  87.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  23.44 
 
 		 1545 aa  87.8  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  24.94 
 
 		 1138 aa  87  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  23.44 
 
 		 1545 aa  86.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.06 
 
 		 1078 aa  85.9  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  30.95 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.39 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  30.84 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  31.97 
 
 		 437 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.09 
 
 		 427 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  28.57 
 
 		 452 aa  83.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.41 
 
 		 362 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.79 
 
 		 429 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  35.14 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 438 aa  82.8  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  25.15 
 
 		 969 aa  82.8  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>