More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0047 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  100 
 
 		 402 aa  820    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  82.54 
 
 		 401 aa  689    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0038  carboxyl-terminal protease  79.6 
 
 		 402 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  82.79 
 
 		 401 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  83.04 
 
 		 401 aa  693    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  91.77 
 
 		 401 aa  727    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  92.27 
 
 		 401 aa  729    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  91.77 
 
 		 401 aa  724    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  82.04 
 
 		 401 aa  686    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  61.31 
 
 		 401 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  61.56 
 
 		 401 aa  501  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  58.79 
 
 		 401 aa  497  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  59.3 
 
 		 401 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0058  C-terminal processing peptidase  58.1 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.871061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  55.42 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.37 
 
 		 433 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  40.16 
 
 		 446 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.99 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  41.59 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  40.96 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.42 
 
 		 443 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 432 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 		 428 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.84 
 
 		 440 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.99 
 
 		 445 aa  260  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.95 
 
 		 445 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  42.11 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 441 aa  256  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  40.68 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.93 
 
 		 436 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.99 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.93 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 468 aa  253  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  38.74 
 
 		 463 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  40.57 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  39.89 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  39.89 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  39.16 
 
 		 507 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  39.76 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.81 
 
 		 423 aa  249  5e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 		 498 aa  249  7e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  41.1 
 
 		 444 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  39.35 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.61 
 
 		 441 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 461 aa  246  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 		 440 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 		 457 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 456 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 458 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 440 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 440 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  40.79 
 
 		 437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 444 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  40.48 
 
 		 437 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 455 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 477 aa  243  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.18 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  39.88 
 
 		 437 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 444 aa  243  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 444 aa  242  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 		 440 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.82 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.6 
 
 		 440 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 439 aa  241  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  35.7 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 		 444 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  37.18 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 		 445 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.93 
 
 		 444 aa  240  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.86 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 535 aa  240  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  35.81 
 
 		 447 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 476 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  38.67 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  34.6 
 
 		 439 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  35.68 
 
 		 550 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.7 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.27 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  39.22 
 
 		 450 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 538 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.38 
 
 		 443 aa  235  8e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  36.96 
 
 		 435 aa  236  8e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  36.1 
 
 		 532 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  36.2 
 
 		 515 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 		 424 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  36.34 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>