More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4863 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  100 
 
 
472 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  50.12 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  47.79 
 
 
452 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1027  peptidase S41  36.09 
 
 
509 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0560517  normal  0.0627841 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  29.73 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
418 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 
472 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  28.11 
 
 
494 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  27.02 
 
 
402 aa  93.6  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  28.52 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  26.12 
 
 
423 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  24.35 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  26.85 
 
 
442 aa  91.3  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 
401 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 
401 aa  91.7  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  30.42 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 
401 aa  90.5  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  25.61 
 
 
401 aa  89.7  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  25.69 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 
397 aa  89.4  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 
415 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 
401 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 
401 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  27.8 
 
 
379 aa  87.4  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 
377 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  25.26 
 
 
438 aa  86.7  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  27.48 
 
 
444 aa  86.7  9e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  30.83 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3039  carboxyl-terminal protease  31.3 
 
 
445 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.619443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  31.52 
 
 
507 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  23.71 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2135  carboxyl-terminal protease  30.15 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 
377 aa  85.5  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  26.83 
 
 
434 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  27.2 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  27.62 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0414  carboxyl-terminal protease  30.57 
 
 
416 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  26.86 
 
 
389 aa  84  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  27.94 
 
 
437 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  27.12 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  24.07 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  25.36 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  26.52 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  27.32 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  32.73 
 
 
566 aa  82  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  27.36 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  32.58 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  30.56 
 
 
436 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 
422 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  25.15 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  26.79 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  27.68 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 
377 aa  79.7  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  26.79 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  26.73 
 
 
446 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.65 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  30.91 
 
 
555 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  27.55 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  28.52 
 
 
538 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  30.88 
 
 
430 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  28.37 
 
 
409 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  29.2 
 
 
470 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  25.68 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  27.83 
 
 
450 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  26.19 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  29.96 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 
484 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  28.11 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  27.59 
 
 
435 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  27.69 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  27.09 
 
 
389 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  31.94 
 
 
553 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  27.96 
 
 
515 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.18 
 
 
407 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  26.63 
 
 
440 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  27.34 
 
 
434 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  28.15 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  31.68 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  25.82 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  26.05 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  26.79 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 
506 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.93 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  28.08 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  27.86 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>