More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0677 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  100 
 
 
426 aa  853    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  62.71 
 
 
434 aa  525  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  40.53 
 
 
415 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  38.76 
 
 
422 aa  263  6e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  36.92 
 
 
433 aa  223  4e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  33.5 
 
 
447 aa  184  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  33.97 
 
 
405 aa  170  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  34.84 
 
 
444 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  32.86 
 
 
438 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  27.25 
 
 
428 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  30.4 
 
 
421 aa  113  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
428 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  26.55 
 
 
428 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  26.9 
 
 
427 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  28.57 
 
 
429 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  29.57 
 
 
394 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 
430 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 
430 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 
444 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  29.92 
 
 
560 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  25.79 
 
 
418 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  26.72 
 
 
400 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  25.85 
 
 
444 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 
379 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
423 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  27.9 
 
 
441 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.33 
 
 
434 aa  100  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  27.97 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  25.86 
 
 
444 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  26.1 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  29.55 
 
 
476 aa  97.8  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  27.91 
 
 
441 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  28.87 
 
 
440 aa  96.7  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  27.56 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  29.71 
 
 
480 aa  94  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  28.12 
 
 
413 aa  94  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  30.96 
 
 
387 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  26.5 
 
 
433 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  28.14 
 
 
556 aa  92.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 
472 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 
447 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  27.86 
 
 
483 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  26.22 
 
 
425 aa  91.7  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 
458 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  28.65 
 
 
445 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 
429 aa  90.5  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  26.15 
 
 
455 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 
429 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  28.75 
 
 
436 aa  89.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  26.8 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  26.38 
 
 
547 aa  89.7  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  27.65 
 
 
446 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  28.37 
 
 
445 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  26.36 
 
 
498 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  26.14 
 
 
440 aa  89.4  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.87 
 
 
407 aa  89  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  28.46 
 
 
417 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.49 
 
 
431 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  27.58 
 
 
439 aa  88.2  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 
535 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  28.81 
 
 
389 aa  89  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  27.48 
 
 
440 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  26.51 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  27.83 
 
 
532 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.8 
 
 
446 aa  87.4  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  27.6 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1647  peptidase S41  28.62 
 
 
596 aa  87  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.754893 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 
457 aa  87  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 
468 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 
423 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  27.65 
 
 
438 aa  86.3  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  28.25 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  28.08 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  26.72 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  23.55 
 
 
544 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  27.1 
 
 
540 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  27.51 
 
 
555 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0582  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000258351  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  28.44 
 
 
478 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  27.54 
 
 
417 aa  84.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
436 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  25.51 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  29.19 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 
401 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  28.34 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.54 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  25.98 
 
 
452 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 
439 aa  84  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  25.78 
 
 
505 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  27.08 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>