More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1209 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  100 
 
 		 422 aa  845    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  43.1 
 
 		 433 aa  267  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  41.57 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  41.63 
 
 		 415 aa  262  8.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  38.76 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  36.57 
 
 		 447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  34.72 
 
 		 405 aa  179  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  35.59 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  31.63 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  30.65 
 
 		 446 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  28.75 
 
 		 434 aa  106  9e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  28.17 
 
 		 429 aa  103  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  26.33 
 
 		 379 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  27.18 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  29.25 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 400 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  28.57 
 
 		 429 aa  99.8  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  26.8 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  26.87 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  30.51 
 
 		 457 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  26.96 
 
 		 430 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  28.08 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  27.3 
 
 		 436 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  24.92 
 
 		 423 aa  97.4  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  26.96 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  26.62 
 
 		 483 aa  96.7  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  29.71 
 
 		 377 aa  96.3  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  26.34 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 		 457 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  27.35 
 
 		 436 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.38 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.93 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  28.19 
 
 		 554 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  30.22 
 
 		 437 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.37 
 
 		 446 aa  93.6  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  27.76 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.83 
 
 		 453 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  27.7 
 
 		 515 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  28.53 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.83 
 
 		 440 aa  93.2  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  29.91 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  29.91 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.97 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  27.33 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  29.61 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  27.33 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  27.33 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  27.33 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  27.64 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  25.42 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  27.78 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  28.79 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  27.99 
 
 		 530 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  27.33 
 
 		 524 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  23.87 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  27.75 
 
 		 515 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  27.62 
 
 		 521 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 515 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 515 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  28.49 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 		 513 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  27.11 
 
 		 515 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  25.72 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 		 511 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  28.32 
 
 		 522 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  28.32 
 
 		 526 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  30.24 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  29.74 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  27.75 
 
 		 549 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  30.24 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  26.61 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  28.03 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  30.03 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  25.71 
 
 		 383 aa  87.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  26.13 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  25.57 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  28.91 
 
 		 438 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  28.57 
 
 		 478 aa  87  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  28.36 
 
 		 488 aa  87  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 		 478 aa  86.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 422 aa  86.7  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  26.32 
 
 		 532 aa  86.3  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  26.96 
 
 		 550 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  24.2 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  25.67 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  27.03 
 
 		 439 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  24.53 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  27.36 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  26.84 
 
 		 535 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>