More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0277 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  100 
 
 		 447 aa  899    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  36.57 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  36.1 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  36.04 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  35.53 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  32.91 
 
 		 426 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  35.61 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  33.17 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  31.63 
 
 		 405 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  27.41 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  25.63 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  25.31 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  28.52 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  28.84 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  29.15 
 
 		 428 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 429 aa  96.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.89 
 
 		 447 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  26.86 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  27.39 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  27.63 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  27.61 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 432 aa  94  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 444 aa  93.6  6e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.66 
 
 		 470 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  27.2 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.62 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07911  carboxyl-terminal processing protease  27.47 
 
 		 450 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  0.0109245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  29.68 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  28.61 
 
 		 423 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  27.76 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  28.66 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  29.1 
 
 		 396 aa  91.3  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  31.27 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.56 
 
 		 429 aa  90.1  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  25.13 
 
 		 425 aa  90.5  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  26.68 
 
 		 429 aa  90.1  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.2 
 
 		 402 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  27.87 
 
 		 402 aa  90.1  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  28.89 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  29.1 
 
 		 417 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  29.87 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  28.42 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  28.24 
 
 		 550 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  30.39 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  29.87 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 449 aa  87.8  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  29.61 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  26.37 
 
 		 547 aa  88.2  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  27.18 
 
 		 433 aa  87.8  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  30.69 
 
 		 428 aa  87.4  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  31.82 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  27.73 
 
 		 549 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  30.22 
 
 		 463 aa  86.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  26.99 
 
 		 688 aa  86.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  29.39 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  29.39 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  28.45 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  26.79 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  24.46 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.13 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  29.54 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 538 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  28.71 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1430  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 		 504 aa  85.1  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729233 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  27.97 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  30.03 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.17 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  26.91 
 
 		 428 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  30.03 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.56 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  28.76 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.46 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  30.52 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  27.22 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  25.96 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  31.25 
 
 		 399 aa  83.6  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  29.04 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  28.43 
 
 		 477 aa  83.2  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  29.41 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  25.26 
 
 		 694 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  26.32 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1326  carboxyl-terminal protease  28.5 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.91473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>