More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4004 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
399 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1729  carboxyl-terminal protease  49.47 
 
 
396 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  37.07 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.06 
 
 
439 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  32.55 
 
 
445 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  32.55 
 
 
445 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  33.69 
 
 
462 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 
400 aa  199  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.39 
 
 
453 aa  199  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 
476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.17 
 
 
468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  35.97 
 
 
462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.38 
 
 
426 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  34.88 
 
 
428 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.84 
 
 
455 aa  192  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
430 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.85 
 
 
432 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  35.5 
 
 
451 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 
440 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
430 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 
441 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 
433 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 
401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  32.71 
 
 
434 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 
445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  32.71 
 
 
410 aa  189  5e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  34.53 
 
 
443 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 
440 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  35.55 
 
 
440 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  32.95 
 
 
439 aa  188  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  32.65 
 
 
428 aa  187  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  33.55 
 
 
427 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.6 
 
 
471 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  35.08 
 
 
444 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 
447 aa  186  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 
451 aa  186  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
444 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  33.61 
 
 
449 aa  186  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  33.86 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0669  C-terminal processing peptidase-3  40.51 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  33.6 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  33.88 
 
 
456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  35.83 
 
 
458 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 
417 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 
428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  36 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  30.91 
 
 
435 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 
379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  35.38 
 
 
468 aa  183  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  30.57 
 
 
423 aa  182  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0704  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 
437 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  33.05 
 
 
438 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  35.06 
 
 
456 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 
446 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35 
 
 
429 aa  182  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.29 
 
 
446 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 
441 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  34 
 
 
458 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  34.82 
 
 
444 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  32.9 
 
 
397 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  35.41 
 
 
480 aa  181  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 
459 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  34.83 
 
 
445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  34.57 
 
 
423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  32.8 
 
 
445 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  31.41 
 
 
477 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  33.65 
 
 
444 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  31.06 
 
 
444 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  32.38 
 
 
439 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  30.03 
 
 
430 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  33.59 
 
 
530 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  33.22 
 
 
442 aa  179  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  34.85 
 
 
444 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  36.58 
 
 
507 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  32.82 
 
 
477 aa  178  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  33.69 
 
 
455 aa  178  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  34.47 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
482 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 
515 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  35.69 
 
 
482 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 
481 aa  178  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  34.15 
 
 
452 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  34.47 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  34.47 
 
 
515 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  32.47 
 
 
418 aa  176  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  32.48 
 
 
401 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 
440 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
436 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  31.23 
 
 
457 aa  176  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  33.76 
 
 
426 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.16 
 
 
448 aa  176  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  32.45 
 
 
443 aa  176  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  34.64 
 
 
436 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.16 
 
 
448 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  34.21 
 
 
515 aa  176  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  33.79 
 
 
522 aa  176  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>