More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1216 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  100 
 
 		 438 aa  872    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  35.53 
 
 		 447 aa  182  9.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  34.2 
 
 		 415 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  33.26 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  35.14 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  33.03 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  35.48 
 
 		 422 aa  160  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  31.18 
 
 		 444 aa  119  7.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  29.79 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  27.1 
 
 		 554 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  27.36 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  23.54 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  28.13 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.13 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  28.13 
 
 		 496 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0996  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  26.28 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  28.45 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.29 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  29.26 
 
 		 556 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  25.96 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  30.4 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_002620  TC0725  tail specific protease precursor, putative  28.52 
 
 		 649 aa  74.7  0.000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  25.96 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1721  carboxyl-terminal protease  28.48 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  30.68 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4069  carboxyl-terminal protease  30.21 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.686351 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  27.38 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 		 544 aa  73.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  26.57 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  27.17 
 
 		 488 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 		 423 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  26.04 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  27.49 
 
 		 556 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 		 507 aa  72  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  22 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  26.25 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  29.62 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  22 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  22 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  22 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  26.3 
 
 		 694 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  26.3 
 
 		 697 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  25.09 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  25.56 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  26.09 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46670  predicted protein  26.48 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1022  peptidase S41A, C-terminal protease  26.69 
 
 		 707 aa  70.1  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000400969  normal  0.0227897 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4232  carboxyl-terminal protease  26.44 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  24.04 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  29.39 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  26.16 
 
 		 710 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  25.31 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  26.62 
 
 		 582 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2119  carboxy-terminal protease  25.4 
 
 		 678 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000159277  hitchhiker  0.000525254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  26.78 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  26.02 
 
 		 389 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  22.19 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  22.79 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  28.98 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1783  carboxy-terminal protease  25.2 
 
 		 692 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00680502  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1672  carboxy-terminal protease  25.2 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000704013  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  26.99 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  27.09 
 
 		 680 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  27.45 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  27.27 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  26.12 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  25.32 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  24.52 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  22.2 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  26.11 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  25.92 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  24.93 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  28.33 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  29.72 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1071  carboxy-terminal protease  25.66 
 
 		 675 aa  67.8  0.0000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.461658  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  23.55 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2663  carboxy-terminal protease  24.93 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000297932  hitchhiker  0.0063771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.69 
 
 		 429 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  29.05 
 
 		 442 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  26.65 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  28.87 
 
 		 671 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  22.5 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  27.64 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  23.55 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  24.27 
 
 		 526 aa  66.6  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  25.62 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  27.95 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  28.51 
 
 		 671 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  23.83 
 
 		 401 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 430 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>