More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0676 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0676  peptidase S41  100 
 
 		 405 aa  814    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2829  peptidase S41  63.23 
 
 		 444 aa  539  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.455505 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  34.72 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2828  peptidase S41  35.8 
 
 		 434 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.282259 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1209  peptidase S41  34.72 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000636879  normal  0.518205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0677  peptidase S41  33.97 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0986  peptidase S41  35.15 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.284271  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  31.63 
 
 		 447 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1216  peptidase S41  29.69 
 
 		 438 aa  118  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.683381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  26.2 
 
 		 554 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0168  C-terminal processing peptidase  26.91 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  30.32 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  28.05 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.72 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  25.21 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.91 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.29 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  25.07 
 
 		 676 aa  69.7  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  25.89 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  23.36 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  25.8 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  25.58 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  28.15 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4334  carboxyl-terminal protease  24.45 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0041  carboxyl-terminal protease  25.18 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  22.83 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  25.17 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.03 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0045  carboxyl-terminal protease  24.09 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000223993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  23.18 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  27.07 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0703  carboxyl-terminal protease  21.96 
 
 		 463 aa  67.4  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.65 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  22.63 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4004  carboxyl-terminal protease  27.85 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  30.45 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  27.7 
 
 		 582 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  23.42 
 
 		 550 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  26.49 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  23.2 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  24.2 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  23.46 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4472  C-terminal processing peptidase  22.8 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0890612  hitchhiker  0.000000524725 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  25.9 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  25.31 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  22.33 
 
 		 379 aa  63.9  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  22.5 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  27.64 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  27.98 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  24.72 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.85 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  23.18 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  24.35 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  24.73 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  25.57 
 
 		 515 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  27.8 
 
 		 522 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4879  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  25.88 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  27.8 
 
 		 526 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  23.28 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.24 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  25.28 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  23.29 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4232  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  27.31 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  25.38 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  24.09 
 
 		 418 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  24.77 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  26.75 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  22.46 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  24.33 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  27.22 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  26.42 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  24.26 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  28.42 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  24.56 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 430 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  23.29 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  24.55 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3806  peptidase S41  28.18 
 
 		 509 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  23.19 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  23.29 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  22.46 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  23.96 
 
 		 389 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  23.33 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  24.01 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  24.14 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>